오믹스·바이오인포 문헌 모니터 — 2026-07-28

Europe PMC 후보 128편 → BGE 관련성 게이트 → 채택 44편 (🆕 신규 0) · 로컬 qwen×7 구조화 요약 + 초록 한글 번역 · 사람 입력 0 · 가설발굴은 SEED→H1 엔진으로 분리

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📡 오늘의 신호

• 신규 논문: 0/44편 (모두 기존 보고됨)
• ℹ️ 범례: 🆕 = 이 피드 최초 등장(논문 발행일 아님) · 🔗 = 우리 RAG/프로젝트 도메인 접점
• 🧭 관련성 게이트(축1: in-scope 여부, 임계 rel≥0.44): 후보 128 = 오프토픽 48 + 쿼터/캡컷 36 + 채택 44
• 🏷️ 라벨 신뢰도(축2: 어느 토픽 라벨, 임계 0.5): [기타/미분류] 1편 · 멀티도메인 구제 9편(강등 대신 최상위 라벨 유지). ※rel(0.44)=관련성 통과 여부와 별개 축 — rel 통과했어도 라벨 신뢰도 미달이면 강등.
• 🔬 공개데이터 동반 논문 1편 · accession: GEO:GSE85452, GEO:GSE227835
• 🔗 우리 도메인 접점: proteomics/MS(11), antibody-topdown(11), tox-multiomics(4), addiction-omics(3), neurodegeneration(2)
• 🔎 자동점검 플래그: 13편 — 📄리뷰/perspect(11), 하이프-언어(3), ⚠️수준 불일치(요약 (1)
• 🎯 엔진 gap 연결: 0편(도메인/임계 필터로 전량 탈락 — 정직 보고)

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📄 논문 카드

판정 권위: 🔎자동점검(규칙기반) = 1차 신호 · 🔸LLM 소견 = 미검증 참고용(qwen 비결정론, verdict 아님).

상세 카드 24편(우리 도메인 접점) · 주변 관심 20편(접점 없음 → 하단 제목·rel만)

[HCP] Illuminating the Dark Host Cell Proteome: A host cell protein coverage method for LC-MS impurity assays.

2026-05-09 · Journal of pharmaceutical and biomedical analysis · 10.1016/j.jpba.2026.117555 · rel=0.766 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: DARK-COV 파이프라인은 LC-MS 기반 HCP 분석의 이론적 검출 한계를 예측하며, CHO, E. coli, HEK, Sf9 시스템에서 이론적으로 검출되지 않는 단백질(Dark HCPs)은 전체 프로테옴의 1.0-5.2%에 불과하고 대부분 저분자량으로 위험도가 낮음을 확인했다. 방법·데이터: LC-MS, HCPedia™ 데이터셋(15,000개 이상의 실험 데이터), CHO/E. coli/HEK/Sf9 세포주 검증필요: >15,000개의 실험 데이터셋과 DARK-COV 예측 간의 강한 일치성(concordance)이 실제 시료의 매트릭스 효과나 이온 억제 등을 고려하지 않은 이론적 모델에 대해 얼마나 일반화 가능한지. 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 초록에 명시된 대로 매트릭스 효과, 이온 억제, 농도 의존적 검출 한계를 고려하지 않은 이론적 예측이 실제 복잡한 생체 시료에서의 검출 한계를 정확히 반영한다고 단정하는 것은 방법론적 한계를 과소평가한 것으로 보임

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

액체 크로마토그래피-질량 분석법(LC-MS)을 이용한 숙주 세포 단백질(HCP) 분석은 생물제제 제품의 개별 불순물을 동정하고 정량하여 위험 기반 불순물 평가를 지원한다. 그러나 효소면역측정법(ELISA) 방법과 달리, LC-MS 분석법의 방법 특이적 HCP 커버리지에 대한 체계적인 평가는 아직 명확히 정의되지 않았다. 특히, 특정 분석 조건에서 본질적으로 검출되지 않는 단백질에 대한 주의는 제한적이었으며, 이는 불순물 특성 규명에서 사각지대를 초래할 가능성이 있다. 본 연구에서는 LC-MS 기반 불순물 분석법의 이론적 HCP 커버리지를 평가하기 위한 투명하고 일반화 가능한 in silico 파이프라인인 DARK-COV를 제시한다. 이 파이프라인은 펩타이드 소수성, 전하 상태, 질량 대 전하비(m/z)를 기반으로 한 in silico 소화된 프로테오ーム의 물리화학적 필터링과 분석법 특이적 LC-MS 매개변수를 결합하여 어떤 펩타이드와 단백질이 검출될 수 있는지 예측한다. 두 개 이상의 검출 가능한 펩타이드를 생성하지 않을 것으로 예측된 단백질은 다크 숙주 세포 단백질(Dark Host Cell Proteins)로 분류되었다. 이 파이프라인은 동일한 LC-MS 워크플로우를 사용하여 생성된 경험적으로 관찰된 HCP 펩타이드의 포괄적인 데이터베이스인 HCPedia™에 수집된 15,000회 이상의 LC-MS 분석에서 파생된 대규모 실험 데이터셋을 대상으로 벤치마킹되었다. 개념 증명 실증으로서, DARK-COV는 중국 햄스터 난소(CHO) 세포, 대장균(Escherichia coli), 인간 배아 신장(HEK) 세포, 그리고 Spodoptera frugiperda(Sf9) 세포를 포함한 네 가지 산업적으로 중요한 발현 시스템에 적용되었으며, 이상화된 in silico 조건 하에서 이러한 프로테오ーム에 있는 단백질 중 단 1.0-5.2%만이 이론적으로 검출 불가능할 것으로 예측되었다. 이러한 예측은 검출 가능성의 상한선을 제시하며, 실제 샘플의 매트릭스 효과, 이온 억제, 또는 농도 의존적 검출 가능성은 고려하지 않는다. >15,000개의 LC-MS 데이터셋에 걸친 실험적 관찰 결과와의 비교는 DARK-COV 예측과 강한 일치성을 보여주어, LC-MS 분석법의 검출 범위 밖으로 떨어질 가능성이 있는 단백질의 분류를 지지한다. 기능적 주석 달기와 알려진 고위험 HCP와의 비교는 대부분의 다크 숙주 세포 단백질이 생물제제 불순물 위험과 관련성이 낮은 저분자량 단백질임을 나타냈다. 전반적으로, 이 파이프라인은 LC-MS 분석법에서 이론적 커버리지를 정량화하고 예측을 실험적 관찰과 비교하기 위한 재현 가능한 방법 특이적 접근법을 제공한다. 분석적 사각지대를 식별함으로써, 이 전략은 미검출 HCP의 위험 기반 평가를 지원하며, USP Chapter 1132.1에 기술된 LC-MS 기반 HCP 불순물 분석의 규제적 정당화에 대한 합리적 기반을 제공한다. ⚠️[언어오염: 미정규화 토큰 ['ム']]

[HCP] Deep dive into drug substance HCP patterns for comprehensive safety assessment in recombinant mAb formats.

2026-07-07 · Biotechnology progress · 10.1002/btpr.88540 · rel=0.704 🔗 우리 도메인: proteomics/MS, antibody-topdown

핵심발견: ND와 IAC는 헥사펩타이드 풍부화보다 낮은 농도의 HCP 검출을 크게 확장하며, ND는 항체 기반 방법에서 포착되지 않은 추가적인 저농도 HCP를 고유하게 식별한다. 방법·데이터: LC-MS/MS 기반 분석, 5가지 CHO 세포 발현 재조합 mAb 제품, 헥사펩타이드 풍부화, 면역친화 크로마토그래피(IAC), native digest(ND) 전략 비교 검증필요: 표준 정제 공정이 pull-down 검출 결과에 따라 활성 성분과 상호작용하는 것으로 보이는 제품 특이적 HCP를 제거하기에 불충분할 수 있다는 주장

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

단클론항체(mAb) 치료제에서 공정 관련 불순물인 숙주세포단백질(HCPs)의 존재는 면역원성, 제품 불안정성 및 치료 효능 감소를 포함하는 위험을 제시한다. 따라서 HCP 수준은 모니터링이 필요한 중요한 품질 특성으로 간주된다. 프로젝트의 후기 단계, 제출 후 변경을 포함하여 공정 개발 중 및 공정 변경 후에 잔류 HCPs의 특성 규명은 필수적이다. ELISA의 한계를 극복하기 위해, 특히 낮은 발현량의 개별 HCPs를 식별하는 데 있어 질량분석법 기반 HCPs 분석이 점점 더 많이 사용되고 있다. 본 연구에서 우리는 CHO 세포에서 발현된 5가지 재조합 제품 전반에 걸쳐 낮은 발현량의 HCPs에 대한 LC-MS/MS 기반 검출을 향상시키기 위해 헥사펩타이드(enrichment), 면역친화 크로마토그래피(IAC), 그리고 자연 상태 소화(ND)의 세 가지 농축 전략을 체계적으로 비교하였다. 우리의 결과는 ND와 IAC 모두 헥사펩타이드 농축 및 총 용액 내 소화(in-solution digest)에 비해 식별된 HCPs의 총 수를 크게 확장한다는 것을 보여주었다. IAC는 여러 잠재적으로 중요한 HCPs의 검출을 지원한 반면, ND는 항체 기반 방법으로는 포착되지 않은 추가적인 낮은 발현량의 HCPs를 고유하게 식별하였다. 또한 풀다운 검정(pull-down assays)은 활성 의약 성분(active pharmaceutical ingredient)과 상호작용할 가능성이 있는 제품 특이적 HCPs를 드러냈으며, 이는 표준 정제 단계가 이들의 제거에 충분하지 않을 수 있음을 시사한다. 함께, 우리의 발견들은 심층적인 HCP 프로파일링을 위한 ND와 IAC의 상호 보완적 성격을 강조한다. 우리는 효소 활성을 가진 HCPs로 인해 낮은 제품 또는 폴리소르베이트(polysorbate) 불안정성 문제가 발생할 때 특히, 생물제제 제품에서 잠재적으로 중요한 HCPs의 포괄적인 검출을 보장하기 위해 두 방법의 결합된 적용을 제안한다. 이러한 통합적 접근법은 향상된 제품 안전성과 공정 중 일관된 HCP 제거를 지원한다.

[항체-topdown] Rapid and selective characterization of antibody-drug conjugates in complex sample matrices by native affinity liquid chromatography-mass spectrometry.

2026-01-18 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2618314 · rel=0.656 🔗 우리 도메인: proteomics/MS, antibody-topdown

핵심발견: POROS CaptureSelect FcXL 칼럼과 최적화된 용매/MS 파라미터를 결합한 1D aLC-MS 방법은 시료 전처리 최소화 및 크로마토그래피 피크 적분 없이 혈청 내 ADC의 DAR, DLD 및 상대적 약물 농도를 정확하고 고속으로 분석 가능 방법·데이터: aLC-MS, POROS CaptureSelect FcXL 칼럼, 마우스 혈청(안정성 연구 및 농도 계열 평가용) 검증필요: 125-2000 µg/mL 범위에서 R²=0.99의 선형성과 31.25 µg/mL의 감도 한계가 실제 복잡한 생체 시료 매트릭스에서의 정량 신뢰도를 충분히 보장하는지

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

항체-약물 접합체(ADC) 및 기타 바이오의약품은 생체 매트릭스 내에서의 생체변환을 평가하기 위해 견고한 분석 방법이 필요하다. 현재의 접근법은 종종 오프라인 농축과 광범위한 크로마토그래피 분리를 필요로 하여 처리량을 제한하고 데이터 처리를 복잡하게 만든다. 우리는 POROS CaptureSelect FcXL 칼럼을 최적화된 용매 및 질량분석기(MS) 파라미터와 결합하여 혈청과 같은 복잡한 샘플 매트릭스에서 ADC 및 기타 항체 유래 형식의 직접 분석(1D aLC-MS)을 가능하게 하는 천연 친화성 액체 크로마토그래피-질량분석법(aLC-MS) 방법을 개발하였다. 이 방법은 마우스 혈청에서의 안정성 연구 및 농도 계열을 사용하여 평가되었다. 직접 분석을 통해 크로마토그래피 피크 적분 없이 샘플 간 약물-항체 비율(DAR), 약물 부하 분포(DLD) 및 상대적 약물 풍부도를 정확하게 결정할 수 있었다. 안정성 연구는 혈청과 인산완충액(PBS) 간에 뚜렷한 ADC 생체변환 프로파일을 보여주었으며, 여기에는 과소접합 시스테인 부위에서의 말레이미드 가수분해 및 이황화 결합 교환이 포함되었다. aLC-MS 방법은 혈청에서 125-2000 µg/mL 범위에서 우수한 선형성(R2 = 0.99)을 달성했으며, 31.25 µg/mL까지 민감도를 보였다. 이 빠르고 선택적인 aLC-MS 방법은 최소한의 샘플 준비로 복잡한 매트릭스에서 ADC 품질 특성의 고속 모니터링을 가능하게 하여, 바이오의약품 제품 개발 및 생체분석 응용을 지원한다. 이 방법은 오직 MS 결과에 기반하므로, 데이터 처리 및 보고가 빠르고 자동화가 용이하다.

[중독] Neural, neurotransmitter, and molecular signatures of gray matter volume alterations in digital addiction.

2026-05-20 · Journal of psychiatric research · 10.1016/j.jpsychires.2026.05.027 · rel=0.617 🔗 우리 도메인: addiction-omics

핵심발견: 디지털 중독 환자에서 양측 전대상피질, 좌측 중전두회 및 좌측 내측 안와전두피질의 회백질 부위 감소가 확인되었으며, 이는 세로토닌 및 GABA성 신경전달 시스템과 공간적으로 연관됨. 방법·데이터: VBM 메타분석(SDM), Juspace를 이용한 신경전달물질 지도 공간 상관관계 분석, Allen Human Brain Atlas 기반 PLSR 전사체 해독. 검증필요: GMV 감소 영역과 신경전달물질 지도 간의 공간적 상관관계 및 전사체 분석 결과의 생물학적 타당성 및 재현성.

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

배경 및 목적 디지털 중독(DA)은 소셜 미디어, 게임 및 스마트폰의 강박적 사용을 포함하며 신경생물학적 기반을 가진 행동 중독으로 점차 인식되고 있다. 그러나 신경영상 소견은 여전히 이질적이며, 관련 신경전달물질 및 분자 메커니즘은 명확하지 않다. 본 연구는 디지털 중독(DA)에서 일관된 회색질 부피(GMV) 변화를 규명하고 이들의 신경전달물질 및 전사체 상관관계를 탐색하는 것을 목적으로 하였다. 방법 디지털 중독(DA)군과 대조군 간 회색질 부피(GMV) 변화를 결정하기 위해 시드 기반 d 매핑(SDM)을 이용한 체적 기반 형태측정법(VBM) 메타분석을 수행하였다. Juspace를 사용하여 GMV 변화와 규범적 신경전달물질 지도 간 공간 상관관계를 평가하였다. 알렌 인간 뇌 아틀라스(Allen Human Brain Atlas)를 사용하여 부분 최소제곱 회귀(PLSR)를 통한 전사체 해독을 수행한 후, 유전자 풍부도 분석 및 세포 유형 분석을 실시하였다. 결과 메타분석은 좌우 전대상피질(ACC), 좌측 중전두회(MFG) 및 좌측 내측 안와전두피질(mOFC)에서 GMV 감소를 보였다. 이러한 영역은 세로토닌성 및 GABA성 시스템과 공간적으로 대응되었다. 전사체 분석은 GMV 변화와 연관된 534개의 유전자를 규명하였으며, 이들은 시냅스 기능 및 이온 채널 활동에 풍부하게 표현되었고 주로 흥분성 및 억제성 뉴런에서 발현되었다. 결론 본 다중 규모 통합 분석은 디지털 중독(DA) 관련 GMV 변화를 특정 신경전달물질 시스템 및 유전자 발현 프로파일과 연결한다. 본 소견은 세로토닌성, 억제성 및 보상 관련 신경생물학적 시스템의 관여에 대한 수렴적 증거를 제공하며, I-PACE 프레임워크 내에서 디지털 중독(DA)에 대한 보다 포괄적인 신경생물학적 이해에 기여할 수 있다.

[ADC] Trial watch: antibody-drug conjugates in cancer therapy.

2026-05-03 · Oncoimmunology · 10.1080/2162402x.2026.2667160 · rel=0.606 🔗 우리 도메인: tox-multiomics, antibody-topdown

핵심발견: ADC는 단클론항체의 표적 특이성과 소분자 약물의 세포독성을 결합하여 혈액암 및 고형암에서 임상적 이득을 보였으며, 특히 후기 임상시험에서 전반적 생존율 개선이 확인되었다. 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: ADC의 설계 원칙(표적 부위, 링커 화학, 약물 대 항체 비율 등)이 약동학, 세포내 이동, 비스라이더 효과 및 독성에 어떻게 구체적으로 영향을 미치는지에 대한 인과적 관계의 명확성

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

항체-약물 접합체(ADC)는 단클론항체의 표적 특이성과 소분자 화합물 페이로드의 세포독성 효능을 결합한다. 최근 몇 년간 ADC는 현대 정밀 종양학의 임상적으로 검증된 구성 요소로 부상했다. 현재까지 종양학적 적응증으로 12종 이상의 ADC가 FDA 승인을 받았으며, 지역적으로 추가적인 제제가 승인되었고 수백 종의 ADC 기반 요법이 임상 개발 중이다. 이들 치료법은 혈액암과 고형암을 포함한 다양한 영역에서 임상적 이점을 입증했으며, 특히 후기 임상시험에서 전반적 생존율의 현저한 개선을 보였다. 본 Trial Watch에서는 초기 전임상 개발부터 현재 임상 적용에 이르기까지 이용 가능한 ADC에 대한 개요를 제공한다. 또한 에피토프 표적화, 링커 화학, 페이로드 독성 및 약물-항체 비를 포함하여 임상적으로 성공한 ADC를 뒷받침하는 설계 원리를 요약하고, 이러한 특징들이 약동학, 세포내 수송, 사이드바이더 효과 및 독성에 어떻게 영향을 미칠 수 있는지 논의한다. 마지막으로, 후기 단계 임상시험의 결과와 승인된 제제를 논의하여 향후 방향을 정의한다.

[항체-topdown] Setting expectations for current and future directions of native mass spectrometry in the biopharmaceutical industry.

2026-07-15 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2699078 · rel=0.594 🔗 우리 도메인: proteomics/MS, antibody-topdown

핵심발견: 네이티브 질량분석법(Native-MS)은 mAb, ADC 등 완전한 분자 집합체의 직접 평가를 통해 기존 분석법의 한계를 보완하지만, 처리량과 접근성 문제로 산업계 보급이 제한적이며, 크로마토그래피 연동 및 자동화 기술 발전과 플랫폼 워크플로우 통합을 통해 향후 영향력이 확대될 것으로 전망됨 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: 네이티브 MS의 산업 내 실제 적용 범위와 한계, 그리고 차세대 기술(크로마토그래피 연동, OBE, CDMS 등)이 처리량 및 자동화 문제를 해결하여 고처리량 분석 워크플로우로의 통합 가능성을 뒷받침하는 구체적인 근거 또는 데이터 제시 여부

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

천연 질량 분석법(native-MS)은 학술 연구실에서 광범위하게 탐구되어 왔으나, 바이오의약품 연구 내에서의 실제적 역할은 아직 명확하게 정의되지 않았다. 본 관점 논문에서 우리는 천연 질량 분석법(native-MS)이 현재 어떻게 적용되고 있으며, 확립된 분석 기술에 비해 어떤 고유한 장점을 제공하는지, 그리고 일상적인 특성 분석에는 대체 방법이 여전히 더 실용적인지에 대한 산업계 중심의 견해를 제시한다. 바이오의약품 워크플로우 내에서 특성 분석 전략은 전통적으로 크기 배제 크로마토그래피(SEC), 이온 교환 크로마토그래피(IEX), 전기영동, 광산란, 열량측정법, 그리고 변성 액체 크로마토그래피(LC) MS와 같은 직교 기술에 의존해 왔다. 천연 질량 분석법(native-MS)은 단클론 항체(mAbs), 다특이성 항체, 항체-약물 접합체(ADCs), 당단백질 및 단백질 복합체를 포함한 완전한 분자 어셈블리의 직접적 평가를 가능하게 함으로써 이러한 방법들을 보완한다. 적용 분야에는 고차원 어셈블리 평가, 리간드 또는 보조 인자 결합, 표적 복합체의 화학량론, 그리고 변성 조건 하에서는 가려질 수 있는 이질성 평가가 포함된다. 그러나 처리량, 민감도, 자동화 및 접근성과 관련된 과제들로 인해 산업계 연구실에서의 광범위한 채택은 제한되어 왔다. 크로마토그래피 하이픈화, 온라인 완충액 교환(OBE), 개선된 자동화 및 전하 검출 질량 분석법(CDMS)을 포함한 새로운 발전들은 이러한 제약 조건들을 해소하기 시작하고 있다. 우리는 바이오의약품 분야에서의 천연 질량 분석법(native-MS)의 미래 영향력이 이러한 기술적 진보들을 치료제 파이프라인 전반에 걸친 높은 처리량의 특성 분석을 지원할 수 있는 플랫폼화된 분석 워크플로우 및 소프트웨어와 통합하는 데 달려있다고 주장한다. 본 논문에서 제기된 아이디어들이 천연 질량 분석법(native-MS)이 언제, 어떻게, 그리고 만약 그렇다면 왜 더 많이 채택되어야 하는지에 대한 논의를 촉발하기를 바란다.

[ADC] Multi-modal feature learning to prioritize ADCs with favorable half-life in mice.

2026-04-17 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2657646 · rel=0.592 🔗 우리 도메인: antibody-topdown

핵심발견: XGBoost 기반 다중 모달 학습 프레임워크를 통해 C57BL/6 마우스에서 mAb 및 ADC의 반감기를 예측했으며, 구조 기반 및 단백질 언어 모델(PLM) 임베딩이 시퀀스 전용 모델보다 높은 예측 정확도(Pearson's r=0.76~0.79)를 보였다. 방법·데이터: 실험적 반감기 데이터 118개(mAbs 및 ADC), C57BL/6 마우스 코호트, 공개데이터셋명 미기재 검증필요: 구조 기반 모델과 PLM 임베딩 간의 예측 성능 우위가 통계적으로 유의미하며, 특히 구조 기반 접근법의 시간적 검증(r=0.79)에서 일반화 능력이 입증되었는가?

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

항체-약물 접합체(ADC)의 유리한 약동학(PK) 특성은 높은 전신 노출을 가능하게 하며 개선된 임상 효능과 연관되어 있으나, ADC의 PK 최적화는 여전히 대부분 경험적이며 자원 집약적이다. 우리는 다중 모달 특징 학습을 사용하여 C57BL/6 마우스에서 단클론 항체(mAb) 및 ADC의 반감기를 예측하기 위한 in silico 프레임워크를 개발하였다. ADC의 구조적 복잡성에 대응하기 위해 각 화합물은 세 가지 구성 요소로 분해되었다: (1) 서열 설명자, AlphaFold 기반 구조적 특성 또는 단백질 언어 모델(PLM) 임베딩으로 표현된 항체 특징; (2) 약물-항체 비율 및 접합 부위를 포함한 접합 관련 특징; (3) 링커-페이로드의 물리화학적 특성. 118개 mAb 및 ADC의 실험적 반감기 데이터를 사용하여 XGBoost 모델이 훈련되었다. 구조 기반 및 PLM 접근법은 강력한 교차검증(Pearson의 r = 0.76)을 달성하여 서열 전용 모델보다 우수한 성능을 보였다. 32개 mAb 및 ADC의 시간적 검증에서 구조 기반 모델은 견고한 일반화(r = 0.79)를 입증하였다. PLM 임베딩은 유사한 순위 순서(Spearman의 ρ, ESM-2의 경우 최대 0.81)를 달성했으나 구조 기반 모델에 비해 정량적 정확도는 낮았다. 전반적으로 본 연구는 합성 및 in vivo 시험 전에 mAb 및 ADC의 초기 PK 선별을 위한 확장 가능한 머신러닝 프레임워크를 제시한다.

[항체-topdown] Glycan pairing in therapeutic IgG orchestrates Fcγ receptor engagement and ADCC: an integrated structure-function approach for thorough evaluation of Fc N-glycans as critical quality attributes.

2026-04-02 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2652642 · rel=0.59 🔗 우리 도메인: tox-multiomics, antibody-topdown

핵심발견: 리툭시맙을 모델로 한 정제된 대칭/비대칭 Fc 글리칸 쌍 변이체 분석 결과, 단일 비푸코실화만으로도 FcγRIIIa 결합 및 ADCC 효능을 최대화할 수 있었으며, 갈락토실화나 고만노스 종은 미미하거나 수용체 특이적인 효과를 보였다. 방법·데이터: 정제된 대칭/비대칭 Fc 글리코-쌍 변이체(제어 화학효소적 재구성 및 정제), 표면 플라즈몬 공명(SPR)을 통한 인간 FcγR(FcγRI, IIa-H131/R131, IIIa, IIIb) 결합 분석, 세포 기반 ADCC 보고자 유전자 검정. 검증필요: FcγRIIIa에서 단일 비푸코실화가 최대 결합을 유도한다는 주장과 고만노스 종이 비푸코실화 복합형보다 낮으나 완전 푸코실화형보다 높은 친화도를 보인다는 결합 데이터의 생물학적 타당성 및 정량적 검증. 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 고만노스 종이 비푸코실화 복합형보다 낮은 친화도를 보인다고 명시되었으나, 일반적으로 고만노스 글리칸은 FcγRIIIa에 대한 높은 친화도와 강한 ADCC 활성을 유발하는 것으로 알려져 있어(교과서적 사실), 초록의 서술이 기존 문헌과 상충되거나 특정 조건(예: 비푸코실화 상태와의 상호작용)을 명확히 구분하지 않아 오해의 소지가 있음

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): ⚠️하이프-언어(과장 소지)

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

단클론 항체(mAbs)는 항원 결합 및 Fc 수용체(FcRs) 또는 보체 시스템과의 상호작용을 통해 치료적 활성을 매개할 수 있다. FcRs는 면역 세포에 발현되며 항체 의존성 세포 매개 세포독성(ADCC) 및 항체 의존성 세포 매개 식균작용과 같은 효과기 기능을 개시할 수 있다. 면역글로불린 G(IgG)의 보존된 Fc N-글리칸은 N297 위치에서 Fc-FcγR 상호작용의 강도와 안정성 및 결과적인 효과기 반응을 조절한다. 기존의 분석 방법은 일반적으로 개별 글리칸을 고립된 상태로 고려하며, 각 Fc 부분이 대칭적으로 또는 비대칭적으로 짝을 이룰 수 있는 두 개의 N-글리칸을 운반한다는 사실을 간과한다. IgG Fc 부위에 대한 최근 연구들은 글리칸 페어링이 Fc-FcR 상호작용을 상당히 형성할 수 있음을 보여주었다. 본 연구에서는 리툭시맙을 모델로 사용하여 완전한 길이의 IgG를 통해 글리칸 페어링의 영향을 평가하였다. 통제된 효소-화학적 재설계 및 정제를 통해 순수하고 균일한 대칭 및 비대칭 Fc 글리코-페어링 변이체들을 생성하였다. 광범위한 인간 FcγRs 패널에 걸친 표면 플라즈몬 공명 결합 연구는 수용체 및 알로타입 특이적 효과를 드러냈다: FcγRI 결합은 본질적으로 영향을 받지 않았으며, FcγRIIa는 알로타입 의존성을 보여주었는데, FcγRIIa-H131은 주로 갈락토실화에 의해 조절되었고 FcγRIIa-R131은 무푸코실화에 의해 조절되었다. 반면 FcγRIIIa는 최대 결합에 도달하기 위해 단 하나의 무푸코실화만 필요로 하였다. 갈락토실화는 작고 수용체 의존적인 효과를 발휘하였으며, 이는 FcγRIIIb에서 가장 두드러졌다. 고만노스 종은 FcγRI 및 FcγRII에 대한 결합을 감소시켰으나, 무푸코실화된 복합형보다 낮지만 완전한 푸코실화 변이체보다는 높은 중간 친화력을 FcγRIIIa에 대해 나타냈다. 생물학적 관련성을 평가하기 위해 세포 기반 ADCC 리포터 유전자 검사는 단 하나의 무푸코실화가 ADCC 효능 증가를 유도하기에 충분하며, 갈락토실화와 고만노스는 작거나 문맥 의존적인 효과만 기여함을 확인하였다. 종합하면, 이러한 발견들은 글리칸 페어링을 치료용 항체의 중요한 품질 속성으로 확립하며, Fc N-글리칸의 중요성에 대한 정밀한 평가 및 정의된 효과기 기능 프로필을 가진 mAbs를 설계하기 위한 틀을 제공한다.

[DAR] An intrinsically hydrophilic linker enables a stable, high-DAR exatecan-based HER2 ADC with potent antitumor activity.

2026-06-10 · European journal of medicinal chemistry · 10.1016/j.ejmech.2026.119054 · rel=0.562 🔗 우리 도메인: tox-multiomics, antibody-topdown

핵심발견: 친수성 링커(SMP-70067-L)를 활용한 HER2 항원표적 ADC(SMP-70067-X)는 높은 DAR(7.92)와 낮은 응집성을 보이며, DS-8201a 대비 HER2 중간 및 낮은 발현 xenograft 모델에서 유의미하게 향상된 항종양 효능을 나타냈다. 방법·데이터: ADC 설계 및 평가(체외/체내 xenograft 모델). 초록 미기재 검증필요: DS-8201a 대비 항종양 효능의 우위가 SMP-70067-X의 높은 DAR와 링커 설계에 기인한 것인지, 혹은 다른 변수(예: 항원 결합 친화도 차이)에 의한 것인지에 대한 인과관계 검증

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

항체-약물 접합체(ADC)는 단클론 항체의 표적 특이성과 소분자 약물의 강력한 세포독성을 결합한다. 그러나 강력한 토포이소머라제 I 억제제인 엑스테카َن(Exatecan)을 사용한 ADC 개발은 그 소수성으로 인해 응집, 빠른 제거 및 표적 외 독성이라는 과제를 겪어왔다. 본 연구에서는 높은 약물-항체 비율(DAR 7.92)을 가진 균일한 엑스테카َن 기반 HER2 표적 ADC(SMP-70067-X)를 구축할 수 있는 본질적으로 친수성 약물-연결체 플랫폼(SMP-70067-L)의 설계를 보고한다. PEG 또는 폴리사르코신 사슬 없이 친수성 자가소멸 스페이서를 통해 높은 DAR을 달성하는 트라스투주맙 데룩스테칸(DS-8201a)과 유사하게, SMP-70067-L은 글루탐산 잔기와 변형된 방향족 자가소멸 스페이서를 포함하는 최소한의 친수성 요소를 통합하여 친수성, 안정성 및 효율적인 약물 방출을 균형 있게 맞춘다. 결과적으로 얻어진 ADC는 DS-8201a에 비해 HER2 중간 발현 및 HER2 저발현 이식편 모델에서 낮은 응집( 50 값)과 현저히 향상된 항종양 효능을 나타낸다. 이러한 결과는 소수성 토포이소머라제 I 억제제 기반 ADC의 치료 지평을 확장하기 위한 합리적 연결체 공학의 중요한 역할을 강조한다.

[ADC] Targeting IL-7Rα with PNU-159682 antibody-drug conjugates in acute lymphoblastic leukemia: translational implications.

2026-04-27 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2663639 · rel=0.56 🔗 우리 도메인: antibody-topdown

핵심발견: IL-7Rα 표적 항원결합항체(PNU-159682 연결)는 MMAE 연결체 대비 50배 이상 강력한 효능을 보였으며, 낮은 용량으로 전신 및 중추신경계(CNS) 백혈병의 완전한 종양 퇴각과 내구성 있는 질병 조절을 달성했다. 방법·데이터: 오믹스 미기재, 코호트 미기재, 공개데이터셋 미기재 검증필요: PNU-159682 연결체가 MMAE 연결체 대비 50배 이상 강력한 효능을 보이는 실험적 재현 및 CNS 침투에 대한 직접적 증거 검증

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

재발성 급성 림프모구 백혈병(ALL), 특히 중추신경계(CNS) 침범을 동반한 경우, 기존 튜불린 억제제를 함유한 항체-약물 접합체(ADCs)로는 불충분하게 조절되며 여전히 치료 실패의 주요 원인으로 남아 있다. 이러한 한계를 해결하기 위해 우리는 IL-7Rα 표적 monoclonal antibodies를 개발하고 클론 577을 선도 후보물질로 동정하였다. 이 항체를 사용하여 우리는 monomethyl auristatin E(MMAE) 또는 고강도 DNA 손상성 화물-PNU-159682(PNU)와 접합된 ADCs를 생성하였다. 직접 비교 시험에서 577-PNU는 in vitro에서 577-MMAE보다 50배 이상의 효능을 보였으며, 20배 낮은 용량에서 xenografts에서 완전한 종양 퇴행을 유도하였다. 또한 577-PNU는 예방적 및 확립된 쥐 CNS 질환 모델 모두에서 지속적인 전신 질환 조절을 제공하며 뇌와 척수에서의 백혈병 침윤을 현저히 감소시켜, 효과적인 CNS 침투에 대한 직접적인 증거를 제시하였다. 안전성 평가는 안정적인 체중, 정상적인 혈액학 및 혈청 생화학, 그리고 치료 관련 병리소견이 없음을 보여주었다. 종합적으로, 이러한 소견들은 DNA 표적 화물인 PNU-159682를 탑재한 IL-7Rα 지향 ADCs가 허용 가능한 용량에서 전신 및 CNS 백혈병의 지속적 제거를 달성할 수 있다는 최초의 전임상적 증거를 제공하며, 임상적 실행 가능성과 CNS 질환 조절을 입증하고, 재발성 및 난치성 ALL에서의 변역 및 임상 개발을 위한 설득력 있는 근거를 확립한다.

[ELISA] Development of a novel electrochemical impedance spectroscopy-based biosensor for bone formation-resorption biomarker determination in body fluids.

2026-07-04 · Bioelectrochemistry (Amsterdam, Netherlands) · 10.1016/j.bioelechem.2026.109371 · rel=0.554 🔗 우리 도메인: antibody-topdown

핵심발견: PINP 및 β-CTX 바이오센서는 각각 10-60 ng/mL 및 10-60 pg/mL의 선형 검출 범위를 보였으며, ELISA 및 ECLIA 대비 높은 상관관계(r ≥ 0.9977)와 84-105.6%의 회수율을 나타냈다. 방법·데이터: 전기화학적 임피던스 분광법(EIS) 기반 바이오센서 개발, 인공 혈청/타액/소변 샘플 사용, ELISA 및 ECLIA 비교 검증. 초록 미기재 검증필요: 인공 체액(Artificial serum) 및 타액/소매에서의 검출 한계(LOD)와 선형 범위가 실제 임상 환자 샘플에서도 동일하게 유지되는지 여부

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Background This study aimed to develop a sensitive, selective, and cost-effective electrochemical impedance biosensor for the individual monitoring of two key bone turnover biomarkers: Procollagen Type I N-Terminal Propeptide (PINP) and β-C-Terminal Telopeptide (β-CTX). Materials and methods Gold (Au) electrodes were modified with 3-mercaptopropionic acid (3-MPA) to form a self-assembled monolayer (SAM). Monoclonal antibodies specific to PINP and β-CTX were covalently immobilized via EDC/NHS chemistry. Each immobilization step was characterized by Electrochemical Impedance Spectroscopy (EIS) and Cyclic Voltammetry (CV). Biosensor performance was evaluated in artificial serum, saliva, and urine, and compared against ELISA and ECLIA reference methods. Results Under optimized conditions, the β-CTX biosensor demonstrated a linear detection range of 10-60 pg mL -1 (LOD: 2.9 pg mL -1 ), and the PINP biosensor a range of 10-60 ng mL -1 (LOD: 3.4 ng mL -1 ). Recovery values ranged from 84% to 105.6%. Strong correlations were obtained with ELISA and ECLIA (r ≥ 0.9977; p  Conclusions The developed biosensor system enables determination of PINP and β-CTX in serum and non-invasive body fluids (saliva and urine), offering a low-cost, rapid alternative to conventional methods for monitoring metabolic bone diseases.

[프로테오지노믹스] Multiomics combined with machine learning defines unique molecular subtypes of cholangiocarcinoma and identifies TNK1 as a therapeutic target.

2025-09-29 · Hepatology (Baltimore, Md.) · 10.1097/hep.0000000000001535 · rel=0.53 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: 전장 엑솜, 전사체, 단백질/인산단백질체 분석과 머신러닝을 통해 담관암의 3가지 분자 하위군(면역조절, 대사, 유전자조절/세포 운명)을 규명했으며, 대사군에서 TNK1이 치료 표적으로 확인되어 TP-5801로 종양 성장 억제 효과를 보였다. 방법·데이터: WES, mRNA-seq, 단백질체/인산단백질체 분석, PDX 모델, 공개 데이터셋 통합 검증필요: 공개 데이터셋과 내부 데이터의 통합 분석에서 면역조절 하위군이 gemcitabine/cisplatin에 가장 반응성이 높다는 주장의 재현성 및 임상적 타당성

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): ⚠️수준 불일치(요약 '전사체' vs 원문 'protein') — 요약 오역 의심

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

배경 및 목적 담도암(CCA)은 분자적 이질성과 치료 저항성을 특징으로 하는 가장 치명적인 암 중 하나이다. 새로운 생물학적 신호와 치료 기회를 규명하기 위해 우리는 머신러닝을 결합한 다오믹스(multiomic) 특성 분석을 활용하였다. 접근법 및 결과 우리는 전장 엑솜 시퀀싱, mRNA 시퀀싱, 그리고 프로테오믹스/인산프로테오믹스 분석을 사용하여 모든 해부학적 CCA 아형을 프로파일링하였다. 통합적 차원 축소는 종양 이질성을 주도하는 RNA, 단백질 및 인산단백질 특성을 드러내어 클러스터링을 가능하게 하였다. 머신러닝 알고리즘은 각 클러스터에 대한 분자 특식을 식별하고 외부 데이터셋 및 환자 유래 이식 모델(PDX)을 이러한 클러스터에 매핑하였다. 키나아제 풍부화 분석은 각 클러스터에서 활성인 표적화 가능한 키나아제를 강조하였다. 클러스터 특이적 PDX 모델에서 선택적 TNK1 억제제인 TP-5801을 사용하여 생체 내 검증이 수행되었다. 우리는 서로 다른 경로 특성을 가진 3개의 분자 클러스터를 식별하였다: 면역조절(클러스터 1), 대사(클러스터 2), 그리고 유전자 조절/세포 운명(클러스터 3). 클러스터 할당은 해부학적 아형과는 독립적이었으나, 치료적 목적의 절제술 이후 전체 생존율과 상관관계가 있었다. 또한 우리는 환자 치료 선택에 중요한 전체 생존율 및 림프절 전이와 연관된 다오믹스 특성과 경로를 식별하였다. 키나아제 풍부화 분석은 대사 클러스터에서 TNK1이 매우 활성인 키나아제임을 지목하였다. TP-5801로 치료한 결과, 대사 PDX 모델에서는 종양 성장이 현저히 감소하였으나, 다른 클러스터를 대표하는 모델에서는 감소하지 않았다. 내부 데이터와 공개적으로 이용 가능한 데이터셋을 결합하여, 우리는 면역조절 클러스터가 gemcitabine/cisplatin 치료에 가장 민감함을 식별하였으며, 이는 클러스터 특이적 PDX 모델을 사용하여 생체 내에서 확인되었다. 결론 통합된 다오믹스 특성 분석은 치료 반응 및 전체 임상 결과와 모두 연관된 고유한 분자 아형을 정의함으로써 전임상적 통찰력을 제공한다. 이 접근법은 TNK1을 정의된 하위 집단의 CCA 종양에서 이전에 인식되지 않은 치료 표적으로 식별하였다.

[프로테오지노믹스] Application of Proteogenomic Approaches for Refinement of the Entamoeba histolytica Reference Genome Using High Resolution Mass-Spectrometry Data.

2026-07-20 · Acta parasitologica · 10.1007/s11686-026-01352-8 · rel=0.524 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: 고해상도 질량분석 데이터 기반 프로테오게노믹 분석을 통해 엔타메바 히스토리티카의 참조 게놈 주석에서 41개의 새로운 단백질 코딩 유전자를 동정하고 18개 유전자의 주석을 정정함. 방법·데이터: 프로테오믹스, E. histolytica HM-1:IMSS trophozoites, 공개 프로테오믹스 데이터셋 검증필요: 480개의 게놈 검색 특이 펩타이드(GSSPs) 매핑을 통해 동정된 41개의 신규 유전자 및 18개 정정 유전자가 실제 번역된 단백질을 코딩하는지 실험적 검증 필요

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

목적 Entamoeba histolytica는 아메바증 또는 아메바성 이질(Colitis)의 원인체로서, 위생 시설이 열악한 지역에서 특히 중요한 글로벌 보건 부담으로 남아 있다. 참조 유전체(Reference genome)가 이용 가능함에도 불구하고, 예측된 유전자 중 상당 비율은 가설적 단백질(Hypothetical proteins)로 주석 처리되거나 실험적 검증이 누락되어 있다. 자동화 유전자 예측 파이프라인의 한계와 기생충의 높은 AT 함량 및 반복 서열로 구성된 유전체 구조로 인해 수많은 코딩 영역이 해결되지 못했으며, 이는 유전체 주석(Genome annotation)을 정교화하기 위한 실험적 접근법의 필요성을 강조한다. 방법 우리는 E. histolytica HM-1:IMSS 영양체(Trophozoites)에서 확보된 공개된 고해상도 단백질체학(Proteomic) 데이터셋을 커스텀 6프레임 번역 유전체 데이터베이스와 비교 검색함으로써 포괄적인 단백질체유전체학(Proteogenomic) 분석을 수행했다. 단백질체 데이터는 Proteome Discoverer 소프트웨어 패키지를 사용하여 1% 위양성 발견률(False discovery rate)로 검색되었다. 결과 데이터베이스 의존적 검색 과정에서 많은 고유 펩타이드(Peptides)가 동정되었으며, 이 중 480개의 펩타이드는 참조 단백질 데이터베이스에 매핑되지 않아 게놈 검색 특이 펩타이드(Genome search-specific peptides, GSSPs)로 명명되었다. 이러한 GSSPs를 게놈에 매핑함으로써 41개의 새로운 단백질 코딩 유전자(Protein-coding genes)를 동정하고, 현재 주석 처리된 18개 유전자의 주석을 수정했다. 보존 도메인 분석(Conserved domain analysis) 결과, 새로 발견된 단백질의 78%가 TLDc 도메인(TLDc domain) 함유 단백질 및 로뱀보이드 펩티다아제(Rhomboid peptidase) 계열 단백질 등 식별 가능한 기능적 도메인을 포함하고 있었다. 비교 분석을 통해 관련 Entamoeba 종 간에 보존된 직교 유전자(Orthologs)가 확인되었다. 결론 본 연구는 펩타이드 수준의 증거를 게놈 데이터와 통합하는 단백질체유전체학(Proteogenomic) 접근법이 E. histolytica의 유전체 주석(Genome annotation)을 크게 개선하고, 알려진 코딩 영역을 확장하며, 기생충 생물학 및 독성 기전(Virulence mechanisms) 이해에 함의를 지닌 이전에 특징이 규명되지 않은 영역에 대한 기능적 통찰력을 제공한다는 사실을 입증한 첫 번째 연구이다.

[중독] Region- and sex-dependent single-cell transcriptomic signatures of neurons and glia in the prefrontal cortex and nucleus accumbens in a rat model of alcohol relapse.

2026-04-27 · Neuropharmacology · 10.1016/j.neuropharm.2026.110995 · rel=0.52 🔗 우리 도메인: addiction-omics

핵심발견: 알코올 박탈 효과(ADE) 모델에서 고음주 쥐의 NAcc GABAergic 중추 신경세포와 mPFC 글루타메르직 신경세포에서 가장 많은 전사체 변화가 관찰되었으며, 이는 세포 유형, 뇌 영역, 성별에 따라 의존적인 분자 서명을 보였다. 방법·데이터: snRNA-seq, RccHan Wistar 쥐(남/여), 알코올 박탈 효과(ADE) 모델, mPFC 및 NAcc 조직. 검증필요: NAcc GABAergic 중추 신경세포와 mPFC 글루타메르직 신경세포에서 관찰된 차등 발현 유전자들이 알코올 재발과 관련하여 인간 AUD에서도 이전에 보고된 도파민 수용체 및 인산다이에스테라제 유전자와 어떻게 연관되는지에 대한 구체적인 생물학적 기전 및 검증.

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Alcohol use disorder (AUD) is characterized by problems controlling alcohol drinking despite adverse consequences, development of tolerance and/or withdrawal symptoms. Notably, sex differences in alcohol consumption patterns and susceptibility to relapse are well documented but remain poorly understood at the molecular level. In this study, we performed single-nuclei RNA sequencing (snRNA-seq) of the medial prefrontal cortex (mPFC) and nucleus accumbens (NAcc) from male and female outbred RccHan Wistar rats exposed to the alcohol deprivation effect (ADE) paradigm, a well-established model of relapse-like drinking behaviour. Comparing high-to low-drinking rats, we found pronounced transcriptional changes across different cell types, with the highest number of differentially expressed genes observed in GABAergic medium spiny neurons (MSNs) of the NAcc and glutamatergic neurons of the mPFC associated with relapse. Importantly, we also identified sex- and region-dependent transcriptional alterations, including differential expression of dopamine receptors and phosphodiesterase family genes, which have previously been associated with AUD in humans, as well as alterations in the transcription of genes associated with synaptic plasticity and neuroimmune signalling. Finally, we found induction of immune-related genes in microglia and sex-dependent activation of immune- and myelination-related genes in astrocytes and oligodendrocytes. These findings highlight cell type-, region-, and sex-dependent molecular signatures associated with alcohol relapse drinking, which may provide new therapeutic targets for AUD.

[프로테오지노믹스] Integrated Proteogenomics and Single-Cell Transcriptomics Prioritize Putative Protective Plasma Proteins for Hidradenitis Suppurativa.

2026-07-01 · Experimental dermatology · 10.1111/exd.70332 · rel=0.515 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: UK Biobank Pharma Proteomics Project의 cis-pQTL을 활용한 두-표본 멘델리안 무작위화 분석 결과, TNFRSF6B, FCRL2, APOD가 화농성 한선염(HS)에 대한 잠재적 보호 인자로 식별되었으며, 단일세포 전사체 분석을 통해 FCRL2와 APOD의 발현 위치가 특정 면역 세포 및 각질형성세포로 국한됨이 확인되었다. 방법·데이터: cis-pQTL(혈장 단백질), UK Biobank Pharma Proteomics Project(노출), FinnGen R12(결과), 단일세포 전사체 분석 검증필요: Bayesian colocalization에서 PP.H4 ≥ 0.5라는 비교적 낮은 임계값을 사용하여 도출된 3개의 단백질이 실제 인과적 기전을 가지는지, 특히 TNFRSF6B의 경우 피부 조직 검출 한계 미만으로 보고되었으나 혈중 순환 decoy receptor로서의 역할이 HS 병인에 직접적으로 기여하는지 추가 검증 필요

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Translating hidradenitis suppurativa (HS) genetic susceptibility into actionable targets remains challenging, as most genome-wide association study loci lie in non-coding regions and tissue-level transcriptomics cannot easily distinguish causal drivers from secondary inflammation. In this study, we aimed to prioritize plasma proteins whose genetically predicted levels are causally associated with HS risk and to localize them within human skin at single-cell resolution. We performed two-sample Mendelian randomization (MR) using cis-pQTL instruments for 2923 plasma proteins from the UK Biobank Pharma Proteomics Project against HS summary statistics from FinnGen R12. Following multiple-testing correction and Bayesian colocalization with a prior-sensitivity grid, the intersection of false-discovery rate (FDR)-significant MR with colocalization evidence (PP.H 4  ≥ 0.5) yielded three putative protective candidates: TNFRSF6B (OR = 0.748, 95% CI 0.666-0.840; PP.H 4  = 0.648), FCRL2 (OR = 0.896, 95% CI 0.819-0.979; PP.H 4  = 0.550), and APOD (OR = 0.789, 95% CI 0.647-0.963; PP.H 4  = 0.503). All sensitivity MR tests were concordant. Single-cell transcriptomic analysis localized FCRL2 and APOD to specific cell populations. FCRL2 was predominantly expressed in B cells and NK cells, while APOD showed multi-cellular expression across cornified keratinocytes, macrophages, and dendritic cells. Furthermore, TNFRSF6B was below the skin detection threshold, supporting its biological role as a circulating decoy receptor. Together, our integrated proteogenomic and single-cell approach prioritizes TNFRSF6B, FCRL2, and APOD as putative protective plasma proteins for HS, with TNFRSF6B emerging as the most genetically robust candidate for future translational follow-up.

[PTM] Ovalbumin oxidative modification fingerprints depend on gas plasma-driven reactive species profiles.

2026-06-17 · Redox report : communications in free radical research · 10.1080/13510002.2026.2688623 · rel=0.51 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: 12가지 아르곤 가스 플라즈마 조건에서 고해상도 질량분석법을 통해 80종 이상의 산화 변이를 아미노산 수준에서 매핑했으며, 원자 상태 산소와 과산화수소가 단백질 산화에 주요하게 관여함을 확인했다. 방법·데이터: 고해상도 질량분석법(High-resolution mass spectrometry), 광방출 분광법(OES), 광도계를 이용한 장수명 종양 정량. 모델 단백질: 닭 난백 알부민(Ovalbumin). 공개데이터셋명: 초록 미기재 검증필요: 원자 상태 산소와 과산화수소의 단백질 산화 기여도가 통계적으로 유의미하다는 주장의 재분석 및 검증 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 원자 상태 산소(원자성 종)가 기체상에서 안정적으로 존재하며 플라즈마 표면에서 직접적인 단백질 산화의 주요 동력으로 작용한다는 생물학적 타당성에 대한 검증 필요. 일반적으로 기체상 원자 산소는 매우 반응성이 높아 수명이 짧으며, 수용액 상 또는 표면에서의 실제 기여도를 OES 및 광도계 데이터만으로 단정하기에는 방법론적 한계가 있을 수 있음

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Objective Oxidative protein modifications have been linked to several diseases, but the variety and diversity of modifications are less studied. Methods We used the chicken egg protein ovalbumin and gas plasma technology, a potent source of various reactive species, for protein oxidation. Using high-resolution mass spectrometry and an in-house workflow, over 80 distinct oxidative protein modifications were mapped at per-amino-acid resolution. To examine how modification profiles depend on changes in reactive species types and concentrations, we generated 12 distinct argon gas plasmas by systematically varying molecular gas admixtures (water, ethanol, oxygen, and nitrogen). Results Optical emission spectroscopy (OES) and photometric determination of deposited long-lived species (hydrogen peroxide, nitrite, and nitrate) were applied to profile gas plasma conditions, revealing the admixture-dependent impact on the reactive oxygen/nitrogen species (ROS/RNS) fingerprint. Correlation analysis with mass spectrometry data revealed the significant involvement of atomic oxygen and hydrogen peroxide in protein oxidation. The enrichment of specific reactive species created by a defined gas plasma composition generated specific ovalbumin oxidation profiles resolved per amino acid. Feed gas-dependent oxidation hotspots, such as Trp149 for dry argon gas or Met274 for hydroxyl radical-rich humidified argon gas, were identified. Discussion This first-of-its-kind study reveals intricate relationships between dynamic reactive species environments and protein oxidation profiles using ovalbumin as a model system.

[DAR] Programmed death 1 antibody drug conjugates (PD 1 ADCs): Innovations in overcoming resistance and enhancing immune mediated antitumor activity.

2026-06-11 · Translational oncology · 10.1016/j.tranon.2026.102830 · rel=0.501 🔗 우리 도메인: tox-multiomics, antibody-topdown

핵심발견: PD-1 항원 발현 종양 미세환경 세포를 표적으로 삼아 세포독성 약물을 전달함으로써 종양 세포 사멸 및 T세포 고갈 회복을 유도하는 2중 기전을 통해 기존 PD-1 억제제의 내성 문제를 극복하고 항종양 면역을 증강한다. 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: 종양 미세환경 내 PD-1 발현 이질성(tumor antigen heterogeneity)과 ADC 링커 불안정성이 실제 임상 개발에서 저항성 기전 및 치료 효능에 미치는 구체적인 영향

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Programmed death-1 (PD-1) antibody-drug conjugates (ADCs) are a new generation of immune checkpoint blockers, which incorporate the delivery of cytotoxic drug targets. The objectives of these ADCs are to selectively target cells in the tumor microenvironment expressing PD-1, causing tumor cells to die, rejuvenating T cell exhaustion, and destroying immunosuppressive cells. PD-1 ADCs aim to address the shortcomings of conventional PD-1 inhibitors, which may be resistant in certain cancers, by harnessing a two-pronged mechanism. This method can also be used to boost antitumor immunity by stimulating the activation and expansion of immune effector cells. Despite promising preclinical and early clinical outcomes, multiple issues remain in the development of PD-1 ADCs, including heterogeneity in tumor antigens, the development of resistance mechanisms, and instability of the ADC linker. Current studies are trying to overcome these challenges by improving ADC engineering, cytotoxic payload optimization, and investigating combination therapy. PD-1 ADCs, with their capacity to specifically regulate immunity and deliver potent cytotoxic drugs directly to tumor cells, have the potential to provide a valuable treatment modality. This would be beneficial for clinical outcomes, especially in cancers resistant to traditional treatment methods, and it represents a great step forward in cancer immunotherapy.

[신경과학·뇌질환] Beyond the gut: the multisite microbiota and its emerging role in brain health.

2026-07-09 · Gut microbes · 10.1080/19490976.2026.2702091 · rel=0.5 🔗 우리 도메인: neurodegeneration

핵심발견: 비장기 미생물군(구강, 피부, 호흡기, 비뇨생식기 등)이 면역 신호, 대사산물, 장벽 무결성 및 직접 신경 경로를 통해 뇌 건강과 신경염증, 신경퇴행성 질환에 영향을 미칠 수 있음을 제시하며, 장-뇌 축 중심의 기존 관점을 넘어 다중 부위 통합 연구의 필요성을 강조함 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: 비장기 미생물군과 뇌 건강 간의 인과관계가 아직 입증되지 않았으며 증거가 이질적이고 간접적이라는 점

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

The human microbiota encompasses diverse microbial communities inhabiting the gut, oral cavity, skin, respiratory tract, and urogenital system, each contributing uniquely to host physiology and health. While the gut microbiota has been extensively studied in the context of brain development and behavior through the microbiota-gut-brain axis, emerging evidence highlights that non-gut microbial ecosystems also shape neuroimmune processes and neurological outcomes. However, evidence supporting non-gut microbiota-brain interactions remains heterogeneous and is often indirect, with causal relationships largely unproven. A growing biological plausibility suggests that oral, skin, nasal, respiratory, and urogenital microbiota influence brain health through immune signaling, microbial metabolites, barrier integrity, and even direct neural pathways. This evidence is derived from a combination of human observational and epidemiological studies, complemented by mechanistic insights from animal models and in vitro systems. Microbial imbalance at these sites has been linked to neuroinflammation, neurodevelopmental alterations, and neurodegenerative diseases, although mechanistic insight remains limited. Moreover, cross-talk between different microbial niches may amplify or mitigate neurological effects, indicating the need for integrative, multi-site, and multi-omics approaches. By critically synthesizing evidence across multiple body sites, this mini-review highlights conceptual gaps, and the need to move beyond a gut-centric framework toward integrative, multisite investigations of microbiota-brain communication.

[DAR] Antibodies to watch in 2026. 🔁멀티도메인구제

2026-01-21 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2614669 · rel=0.495 🔗 우리 도메인: antibody-topdown

핵심발견: 2025년 첫 시장 승인된 항체 치료제 19종과 규제 검토 중인 26종, 그리고 2026년 말 규제 검토 진입이 예상되는 209종의 파이프라인 현황을 분석했으며, 비암 indications(76%)와 conventional format(62%)이 우세했으나 항체-올리고/약물 접합체 등 신규 형식도 다수 포함됨. 방법·데이터: 공개데이터셋명 미기재 (연간 상업적 후기 임상 개발, 규제 검토, 마케팅 승인 현황에 대한 서술적 분석 및 시계열 데이터 기반 기간 산출) 검증필요: 중국산 항체 치료제의 개발 및 승인 기간이 평균적으로 더 짧다는 주장의 통계적 근거 및 편향 통제 여부

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📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

관찰할 항체 시리즈는 항체 치료제의 상업적 후기 임상 개발, 규제 검토 및 마케팅 승인에 대한 연례 업데이트를 제공한다. 2010년 첫 번째 기사가 게재된 이후, 후기 파이프라인은 26개의 항체 치료제에서 200개 이상으로 성장했으며, 동일한 기간 동안 후기 연구에 있는 수많은 분자들이 규제 검토로 전환되어 승인되었거나 중단되었다. 이번 시리즈 호에서 우리는 2025년에 첫 마케팅 승인을 받은 19개의 항체 치료제를 되돌아보고, 이중특이성 항체-약물 접합체(ADC)인 izalontamab brengitecan을 포함한 현재 규제 검토 중인 26개의 분자에 대해 논의하며, 현재 상업적 후기 파이프라인에 있는 209개 분자 중 2026년 말까지 규제 검토로 전환될 가능성이 있는 분자를 예측한다. 후자 범주의 대부분의 항체 치료제는 비암 질환(21개 중 16개, 76%)을 대상으로 하며, 전통적인 형식(21개 중 13개, 62%)을 가지고 있지만, 이 범주에는 delpacibart etedesiran, delpacibart zotadirsen, zeleciment rostudirsen, sonesitatug vedotin, trastuzumab pamirtecan 및 ifinatamab deruxtecan과 같은 항체-올리고뉴클레오타이드 또는 -약물 접합체와 이중특이성 항체 petosemtamab도 포함된다. 항체 치료제 개발은 글로벌 기업이기 때문에, 우리는 또한 2010년 이후 어느 국가에서든 항체 치료제에 부여된 첫 번째 승인의 추세를 항체의 기원 국가별로 분류하여 논의하며, 첫 번째 승인 총수와 중국에서 처음으로 승인된 수의 주목할 만한 증가를 문서화한다. 마지막으로, 임상 개발 및 규제 검토에 일반적으로 필요한 시간을 벤치마킹하기 위해, 우리는 최근 승인된 항체 치료제 제품의 치료 영역, 작용 기전, 형식 및 기원 국가별로 분류하여 이 기간을 계산했다. 우리의 데이터는 개발 및 승인 기간이 일반적으로 약 6년이지만, 평균적으로 중국에서 기원한 제품의 경우 이 기간이 더 짧았음을 보여준다.

[프로테오믹스] Dysregulated proteins in plasma distinguishing Loeys-Dietz syndrome from other heritable thoracic aortic disease - an explorative study. 🔁멀티도메인구제

2026-07-18 · Scandinavian cardiovascular journal : SCJ · 10.1080/14017431.2026.2699504 · rel=0.489 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: LDS 환자군에서 Oncostatin M, Pentraxin 3, TNFRSF9, GNLY, CD5, Vasorin, GP1BA의 혈장 단백질 수치가 건강 대조군에 비해 유의하게 높았으며, 이는 Th17 및 혈소판 관련 기전과 연관됨. 방법·데이터: 타겟 프로테오믹스(immunoaffinity proteomics), 276개 단백질 분석, LDS(n=8), MFS(n=11), familial TAA6(ACTA2, n=7), 건강 대조군(n=16). 검증필요: LDS를 HTAD의 특정 염증 하위 집단으로 구분하는 7가지 단백질 바이오커버의 진단적 유용성 및 임상적 타당성. 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 표본 크기가 극히 작아(LDS 8명, MFS 11명, familial TAA 7명, 대조군 16명) 통계적 검정력이 부족할 수 있으며, 다중 비교 보정 과정이 초록에 명시되지 않아 위양성(false positive) 위험이 있음

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Objectives. Thoracic aortic aneurysms (TAAs) are often found in younger individuals and approximately 20% may be associated with heritable thoracic aortic disease (HTAD). There are some data on genomic biomarkers reflecting inflammation and extracellular matrix remodelling in HTAD. However, data that accurately reflect the corresponding protein changes are scarce. Our aim was to quantify proteins by using targeted proteomics in HTAD patients versus healthy controls, to better understand the underlying pathophysiology. Methods . Patients with Loeys-Dietz syndrome (LDS, n  = 8), Marfan syndrome (MFS, n  = 11), and familial TAA 6, i.e. actin alpha 2 (ACTA2, n  = 7) pathogenic variants were recruited at our outpatient clinic. For comparison, blood samples were drawn from 16 healthy controls. Plasma samples were analysed by targeted proteome analysis of 276 proteins using immunoaffinity proteomics. Results . Whereas oncostatin M and pentraxin 3 levels appeared generally higher in HTAD patients, after adjusting for several confounders, significantly higher levels for these markers as well as TNF receptor superfamily member 9 (TNFRSF9), granulysin (GNLY), CD5, vasorin and glycoprotein 1b-α (GP1BA) were only observed in LDS patients compared to healthy controls. Levels of TNFRSF9, GNLY, GP1BA and CD5 correlated positively with Th17 and platelet counts. Conclusions . This discovery study suggests that LDS could represent a particular inflammatory subgroup of HTAD patients potentially reflecting the involvement of Th17 and platelet related mechanisms in the progression of TAA. Larger studies are needed to evaluate if the identified proteins could be used as biomarkers in these patients.

[신경과학·뇌질환] Therapeutic frontiers in ALS: iPSC-based drug discovery, cell therapy, and gene therapy-Advances through 2026. 🔁멀티도메인구제

2026-06-15 · Regenerative therapy · 10.1016/j.reth.2026.101150 · rel=0.482 🔗 우리 도메인: neurodegeneration

핵심발견: 2020~2026년 사이 ALS 치료 파이프라인이 iPSC 기반 약물 발견, 세포 이식, 유전자 치료를 통해 확장되었으며, TDP-43 기능 장애의 하류 표적인 STMN2가 산발성 ALS 치료의 새로운 가능성을 제시함. 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: STMN2를 표적으로 하는 QRL-201의 타겟 참여(target engagement)에 대한 회사 보고 중간 데이터의 객관적 검증 필요성

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Three converging therapeutic paradigms-iPSC-based drug discovery, cell transplantation, and gene therapy-have substantially expanded the therapeutic pipeline for amyotrophic lateral sclerosis (ALS) between 2020 and 2026. The FDA's accelerated approval of tofersen (Qalsody) in April 2023 marked the first treatment targeting a genetic cause of ALS. iPSC-derived drug candidates, including ropinirole and bosutinib, have completed early-phase clinical trials led by Japanese institutions. Cell therapies targeting neuroinflammation through regulatory T cells are being actively explored as immunomodulatory strategies, although efficacy remains to be established in adequately powered trials. Next-generation gene-silencing approaches-including RNA interference (RNAi) therapeutics and AAV-delivered microRNA-entered first-in-human trials in 2024-2025. The identification of STMN2 as a downstream target of TDP-43 dysfunction has opened a potential TDP-43-downstream nucleic acid therapeutic avenue for sporadic ALS, which constitutes approximately 90% of all cases, with company-reported interim data suggesting target engagement in the ongoing Phase 1/2 ANQUR trial (QRL-201). This review synthesizes the latest evidence across all three therapeutic domains, with attention to the hierarchy of evidence, regulatory milestones, and the pioneering contributions of Japanese research groups.

[중독] Antibiotic-mediated gut microbiota depletion partially attenuates methamphetamine-induced reward and linoleic acid metabolic disturbance. 🔁멀티도메인구제

2026-05-13 · Neuropharmacology · 10.1016/j.neuropharm.2026.111022 · rel=0.463 🔗 우리 도메인: addiction-omics

핵심발견: 메타암페타민(METH) 노출은 장내 미생물 군집을 변화시키고 라놀산(LA) 대사 이상을 유발하며, 항생제(ABX)를 통한 미생물 고갈은 METH 유도 보상 효과 및 LA 대사 교란을 완화한다. 방법·데이터: 마우스 조건부 장소 선호(CPP) 모델, 장내 미생물체(microbiota) 및 대사체(metabolites) 다중 오믹스 프로파일링. 초록 미기재 검증필요: ABX 처리가 METH 유도 보상 행동(CPP 점수)을 통계적으로 유의미하게 감소시켰는지, 그리고 LA 대사 변화가 미생물 고갈에 의해 직접 매개되었는지의 인과적 증거

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Methamphetamine (METH) is a highly addictive psychostimulant that possesses potent toxicity to multiple organs. Emerging evidence has suggested associations between gut microbiota dysbiosis and METH-induced rewarding effects. However, the role and underlying mechanisms of gut microbiota in METH addiction remain poorly understood. Using a mouse conditioned place preference (CPP) model combined with multi-omics profiling of gut microbiota and metabolites, we first investigated how METH exposure affects gut microbiota composition. Then, antibiotic (ABX)-mediated gut microbiota depletion was conducted to explore the role of gut microbiota in the METH-induced associative memory of context-reward (METH reward) and metabolic dynamics. Furthermore, associations among gut microbiota, metabolites, and behavioral phenotypes were determined to reveal the potential key microbial taxa and metabolites in METH reward. Finally, the key metabolite was intervened to reveal the role of it in the METH reward. Our results demonstrated that repeated METH administration induced significant alterations in gut microbiota profiles. ABX-mediated microbiota depletion attenuated METH-induced rewarding effects and metabolic perturbations, especially in linoleic acid (LA) metabolism. METH exposure led to an increase in, while gut microbiota depletion rescued the activation of LA metabolism. Correlation analyses consistently demonstrated associations among specific bacterial species, LA metabolites, and CPP scores. Supplementation of LA could facilitate, while inhibition of its oxidative metabolism could attenuate the METH-induced CPP. These findings highlight LA metabolism as a potential mechanistic link between gut microbiota dysbiosis and METH reward. Future gut microbiota-targeted therapeutic interventions, particularly those modulating LA metabolism, may improve the treatment of METH use disorder.

[프로테오믹스] Identification and profiling of HLA-A*02:01-restricted Toxoplasma gondii peptides through immunopeptidomics in HLA-A2.1 transgenic mice. 🔁멀티도메인구제

2026-07-05 · Virulence · 10.1080/21505594.2026.2697091 · rel=0.449 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: HLA-A02:01 트랜스제닉 마우스 감염 모델에서 MS 기반 면역펩티드믹스를 통해 3,433종의 고신뢰도 T. gondii 유래 펩타이드를 규명하고, 그중 5종을 실험적으로 검증하여 글리코겐 합성효소(PGS) 유래 신규 리간드의 결정구조를 규명함. 방법·데이터: 면역펩티드믹스(HLA-A02:01 트랜스제닉 마우스), in silico 예측, in vitro/in vivo 결합 검증, X-ray 결정구조 분석. 공개데이터셋명 미기재. 검증필요: 73종의 고선별 후보 중 5종만 실험적 검증을 수행하여 대표성 있는지, 그리고 전체 3,433종 펩티드 중 5종(약 0.14%)의 선별 기준이 생물학적/기술적 편향 없이 타당한지 확인 필요. 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 초록에 효과크기(OR 등)나 통계적 유의성 수치(예: p-value, FDR)가 명시되어 있지 않아, '73종 고선별' 및 '5종 검증'의 통계적 엄격성이나 다중검정 보정 여부를 평가할 수 없는 방법론적 한계가 있음

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

HLA class I presentation of pathogen-derived peptides is essential for CD8+ T-cell recognition of Toxoplasma gondii . While in vitro MHC ligands have been documented, the in vivo ligandome during infection progression remains poorly characterized. Here, we employed an MS-based immunopeptidomics approach to directly profile the T. gondii immunopeptidome presented by HLA-A *02:01 in transgenic mice. By employing a hierarchical discovery funnel, our analysis identified a comprehensive repertoire of 3,744 unique T. gondii -derived peptides. Subsequent filtering for canonical 8-12mers, matching the typical binding length for HLA-A *02:01 ligands, established a high-confidence foundational ligandome of 3,433 peptides. Source protein analysis revealed that these peptides originate from diverse parasite proteins, including a substantial proportion of previously uncharacterized hypothetical proteins. Notably, specific ligands were consistently detected across both acute and chronic stages, suggesting stable MHC-I presentation throughout the infection cycle. By integrating in silico predictions with experimental validation, we prioritized 73 high-affinity candidates, five of which exhibited robust HLA-A *02:01 binding capacity in vitro and in vivo . Specifically, we identified a novel ligand derived from glycogen synthase (PGS) and determined its co-crystal structure with HLA-A *02:01, revealing favorable binding architecture. Overall, these findings expand the known HLA-A *02:01-restricted ligand landscape of T. gondii and provide a high-priority list of candidates for future functional validation of CD8+ T-cell immunogenicity.

[생물정보학] INTERPOL Review of Forensic Biology and DNA, 2023-2025. 🔁멀티도메인구제

2026-06-14 · Forensic science international. Synergy · 10.1016/j.fsisyn.2026.100705 · rel=0.449 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: 2023-2025년 법의학 생물학 및 DNA 분석 분야의 최신 동향을 파악하기 위해 Scopus, Web of Science, PubMed 등에서 약 2000건의 참고문헌을 수집·선별하여 15개 주제와 116개 하위 주제로 분류하고, AI 도구를 활용하여 문헌 검토를 수행함. 방법·데이터: 오믹스 종류·코호트·공개데이터셋명. 초록 미기재 검증필요: 초록에 기술된 15개 주제 및 116개 하위 주제 분류 체계와 2000여 건의 문헌 선별 기준이 구체적으로 명시되어 있지 않음.

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

As a part of the 21st INTERPOL International Forensic Science Managers Symposium, this work explores the latest scientific developments, methodologies, and trends in forensic biology and forensic DNA analysis of biological evidence during the years 2023 to 2025 and builds upon previous INTERPOL DNA reviews. Almost 2000 references covering the three-year time range of this review were located via various online searches including use of Scopus, Web of Science, and PubMed. The scientific articles, which originated from more than 300 different journals, were curated in a Zotero reference manager database (see Supplemental File 1) and sorted into 15 topics and 116 sub-topics (see Supplemental File 2) under sections focused on advances in current practices (Section 3) and emerging technologies and research studies (Section 4). This triennial review describes 24 books or major reports, 20 special issues of journals on aspects of forensic DNA, 292 articles from 2 International Society for Forensic Genetics (ISFG) conference proceedings, and 70 guidance documents from 17 different organizations to assist in quality DNA testing. Publications were evaluated and sorted into 10 topics around advances in current practices and 5 topics related to emerging technologies and research studies. These topics, which are further sub-divided in a compiled list (see Supplemental File 2) included rapid DNA analysis; law enforcement DNA databases and ethics; forensic investigative genetic genealogy (FIGG); forensic biology and body fluid identification; DNA processing; DNA typing with short tandem repeat (STR) markers; DNA interpretation at the source or sub-source level of the hierarchy of propositions along with mixture interpretation using probabilistic genotyping software (PGS); DNA interpretation at the activity level along with aspects of DNA transfer, persistence, prevalence, and recovery (TPPR); statistics and population genetic data; human identification and kinship analysis; next-generation sequencing (NGS) and technology developments; forensic DNA phenotyping (FDP) and methylation; lineage markers (Y-chromosome, mitochondrial DNA, X-chromosome analyses); new markers and approaches (microhaplotypes, insertion/deletion markers, proteomics, microbiome, single-cell analysis, using environmental DNA, and biomarkers for diagnosis of sudden death, molecular autopsy, or post-mortem interval); and non-human DNA testing and wildlife forensics. Artificial intelligence (AI) tools for summarizing references were explored and utilized in performing this review of over 1900 publications.

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🔭 주변 관심 (20편 · 관련성 통과했으나 우리 도메인 접점 없음 — 제목·rel만)

• [HCP] Host cell protein profiling and immunogenicity assessment in E. coli-produced interferon beta. · rel=0.685 · 2026-07-14 · Journal of pharmaceutical sciences · 10.1016/j.xphs.2026.104418
• [GWAS] Genetic architecture shared between body shape phenotypes and preeclampsia-related diseases: a genome-wide cross-trait analysis. · rel=0.623 · 2026-07-24 · Journal of obstetrics and gynaecology : the journal of the Institute of Obstetrics and Gynaecology · 10.1080/01443615.2026.2706674
• [멀티오믹스] Multi-omic modelling of body mass index response to a dietary weight loss intervention. · rel=0.6 · 2026-07-15 · Gut microbes · 10.1080/19490976.2026.2696645
• [멀티오믹스] Multiomics integrative bioinformatics analysis of gene expression characteristics and molecular mechanisms in preeclampsia placental tissue. · rel=0.59 · 2026-07-20 · Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology · 10.1080/21691401.2026.2697688
• [RNA-seq] Integrative single-cell and spatial transcriptomic approaches to decipher the tumor microenvironment and therapeutic resistance in pancreatic cancer. · rel=0.571 · 2026-07-07 · Cancer biology & therapy · 10.1080/15384047.2026.2699508
• [RNA-seq] Investigating and validating the molecular mechanisms of lipid metabolism regulation in myasthenia gravis development based on single-cell, bulk transcriptomics, and RT-qPCR. · rel=0.562 · 2026-07-18 · Autoimmunity · 10.1080/08916934.2026.2696588
• [ELISA] Next-generation immunoassays for autoantibody detection in celiac disease: emerging technologies and diagnostic advances. · rel=0.562 · 2026-07-17 · Annals of medicine · 10.1080/07853890.2026.2703356
• [멀티오믹스] Exploratory multi-omics links CCL2/TIMP1 axis to immunosuppressive TME in glioblastoma. · rel=0.555 · 2026-07-15 · Cell cycle (Georgetown, Tex.) · 10.1080/15384101.2026.2703934
• [GWAS] Genetic liability for morning chronotype interacts with childhood trauma to predict depressive symptoms in women. · rel=0.53 · 2026-07-19 · Dialogues in clinical neuroscience · 10.1080/19585969.2026.2702037
• [GWAS] Mitochondria-related pathogenic genes in acute and chronic kidney disease: a Mendelian randomization study. · rel=0.524 · 2026-07-08 · Renal failure · 10.1080/0886022x.2026.2698274
• [약물재배치] Repurposing the antispasmodic drug pinaverium bromide as a novel antifungal agent and synergist against Candida albicans . · rel=0.519 · 2026-06-01 · Virulence · 10.1080/21505594.2026.2682573
• [PTM] The acetylation mechanism and engineering strategy of isocitrate lyase for optimizing biosynthesis in Escherichia coli . · rel=0.518 · 2026-05-23 · Synthetic and systems biotechnology · 10.1016/j.synbio.2026.04.031
• [RNA-seq] Single-cell sequencing profiling of intratumoral heterogeneity and immunosuppressive microenvironment in primary thyroid cancer and lymph node metastases. · rel=0.513 · 2026-07-10 · Oncoimmunology · 10.1080/2162402x.2026.2701504
• [ELISA] A rapid yolk-sac serum extraction method for quantifying maternal IgY of individual birds. · rel=0.513 · 2026-07-03 · MethodsX · 10.1016/j.mex.2026.104027
• [약물재배치] The role of protein palmitoylation in disease pathogenesis and therapeutic innovation. · rel=0.507 · 2026-05-29 · Annals of medicine · 10.1080/07853890.2026.2673182
• [PTM] Eukaryotic cell-free protein synthesis: Chassis diversification, system engineering, and emerging applications. · rel=0.507 · 2026-05-21 · Synthetic and systems biotechnology · 10.1016/j.synbio.2026.04.022
• [희귀질환] Serum metabolic profiling analysis of Gitelman syndrome using untargeted metabolomics. · rel=0.475 · 2026-04-29 · Renal failure · 10.1080/0886022x.2026.2662094
• [약물재배치] Repurposing nitazoxanide as a novel ferroptosis inducer for triple-negative breast cancer via dual disruption of iron homeostasis and the β-catenin/GPX4 axis. · rel=0.473 · 2026-06-29 · Redox report : communications in free radical research · 10.1080/13510002.2026.2695689
• [희귀질환] Transcriptional profiling of Hutchinson-Gilford progeria patients identifies primary target pathways of progerin. · rel=0.44 · 2026-01-05 · Nucleus (Austin, Tex.) · 10.1080/19491034.2025.2611484
• [기타/미분류] Nanozymes: bridging nanoscale characteristics and catalytic mechanisms for advanced biomedical applications. · rel=0.512 · 2026-06-22 · Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry · 10.1080/14756366.2026.2690829

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🩺 실행 진단

• 관련성 게이트: BGE 관련성 게이트 · 후보 128 = 오프토픽 48 + 쿼터/캡컷 36 + 채택 44
• ★캡컷 상위(관련성 통과했으나 쿼터/캡 탈락): Cell culture medium formulation can be a driver of lipoprotein lipase (rel=0.598·HCP); Development of single-chain C1q affinity chromatography-mass spectrome(rel=0.586·항체-topdown); Purification of Advanced Therapeutics by Flow-Through Pseudo-Affinity (rel=0.576·HCP); Key molecular networks underlying retinol's biphasic effects on cell p(rel=0.553·멀티오믹스); Causal association and shared mechanisms between Graves' disease and p(rel=0.523·GWAS)
• 브릿지: 신규 데이터셋 0/0건 유효(관련성·서브시리즈 필터 후) · 엔진 gap 0편(도메인/임계 필터로 전량 탈락 — 정직 보고)
• 라벨 강등(신뢰도<0.5): 1편 [기타/미분류]
• 요약노드 7/8 사용 · 죽은 노드: 172.20.0.19:11209
• 요약 실패(무음 전멸): 0편
• ★무음 부분실패(핵심발견 등 핵심필드 공란): 0편
• ★개체명 불일치(핵심발견 질병명이 타필드와 충돌 — 요약 환각 의심, F-01): 0편
• ★요약↔원문 정합성 위반(심볼 환각·수준 혼동, B게이트): 1편