오믹스·바이오인포 문헌 모니터 — 2026-07-25

Europe PMC 후보 128편 → BGE 관련성 게이트 → 채택 45편 (🆕 신규 1) · 로컬 qwen×7 구조화 요약 + 초록 한글 번역 · 사람 입력 0 · 가설발굴은 SEED→H1 엔진으로 분리

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📡 오늘의 신호

• 신규 논문: 1/45편 — 주제별: ELISA(1)
• ℹ️ 범례: 🆕 = 이 피드 최초 등장(논문 발행일 아님) · 🔗 = 우리 RAG/프로젝트 도메인 접점
• 🧭 관련성 게이트(축1: in-scope 여부, 임계 rel≥0.44): 후보 128 = 오프토픽 47 + 쿼터/캡컷 36 + 채택 45
• 🏷️ 라벨 신뢰도(축2: 어느 토픽 라벨, 임계 0.5): [기타/미분류] 1편 · 멀티도메인 구제 9편(강등 대신 최상위 라벨 유지). ※rel(0.44)=관련성 통과 여부와 별개 축 — rel 통과했어도 라벨 신뢰도 미달이면 강등.
• 🔬 공개데이터 동반 논문 2편 · accession: GEO:GSE330115, PRIDE:PXD078146, GEO:GSE85452, GEO:GSE227835
• 🔗 우리 도메인 접점: antibody-topdown(11), proteomics/MS(11), tox-multiomics(4), addiction-omics(3), neurodegeneration(2), rare-disease(1)
• 🔎 자동점검 플래그: 12편 — 📄리뷰/perspect(11), 하이프-언어(3)
• 🆕 신규 공개 데이터셋: 1건(PRIDE/GEO — 재분석 후보, 하단 목록)
• 🎯 엔진 gap 연결: 0편(도메인/임계 필터로 전량 탈락 — 정직 보고)

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📄 논문 카드

판정 권위: 🔎자동점검(규칙기반) = 1차 신호 · 🔸LLM 소견 = 미검증 참고용(qwen 비결정론, verdict 아님).

상세 카드 25편(우리 도메인 접점) · 주변 관심 20편(접점 없음 → 하단 제목·rel만)

[ELISA] Development of a novel electrochemical impedance spectroscopy-based biosensor for bone formation-resorption biomarker determination in body fluids. 🆕

2026-07-04 · Bioelectrochemistry (Amsterdam, Netherlands) · 10.1016/j.bioelechem.2026.109371 · rel=0.554 🔗 우리 도메인: antibody-topdown

핵심발견: PINP 및 β-CTX용 전기화학적 임피던스 바이오센서를 개발하여 인공 혈장, 타액, 소변에서 ELISA 및 ECLIA 대비 높은 상관관계(r ≥ 0.9977)와 적절한 회수율(84~105.6%)을 보임. 방법·데이터: 전기화학적 임피던스 분광법(EIS) 기반 바이오센서; 인공 혈장, 타액, 소본용 시료; ELISA 및 ECLIA 비교 검증 검증필요: 인공 혈장(artificial serum)에서의 성능이 실제 임상 혈장 시료에서도 동일하게 유지되는지 및 비침습적 체액(타액, 소변)에서의 실제 임상적 유용성

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

배경 본 연구는 두 가지 주요 골전환 바이오마커인 프로콜라겐 타입 I N-말단 프로펩타이드(PINP)와 β-C-말단 텔로펩타이드(β-CTX)의 개별 모니터링을 위해 민감하고 선택적이며 비용 효율적인 전기화학적 임피던스 바이오센서를 개발하는 것을 목표로 하였다. 재료 및 방법 금(Au) 전극을 3-머캅토프로피온산(3-MPA)으로 수정하여 자가 조립 단분자층(SAM)을 형성하였다. PINP 및 β-CTX에 특이적인 단클론 항체를 EDC/NHS 화학을 통해 공유결합으로 고정하였다. 각 고정 단계는 전기화학적 임피던스 분광법(EIS) 및 순환 전압전류법(CV)으로 특성화하였다. 바이오센서의 성능은 인공 혈청, 타액 및 소변에서 평가되었으며, ELISA 및 ECLIA 기준 방법과 비교되었다. 결과 최적화된 조건에서 β-CTX 바이오센서는 10-60 pg mL-1의 선형 검출 범위(LOD: 2.9 pg mL-1)를 보였고, PINP 바이오센서는 10-60 ng mL-1의 범위(LOD: 3.4 ng mL-1)를 보였다. 회수값은 84%에서 105.6% 범위였다. ELISA 및 ECLIA와 강한 상관관계(r ≥ 0.9977; p < 0.001)가 관찰되었다. 결론 개발된 바이오센서 시스템은 혈청 및 비침습적 체액(타액 및 소변)에서 PINP 및 β-CTX를 결정할 수 있으며, 대사성 골질환 모니터링을 위한 기존 방법 대비 저비용이고 신속한 대안을 제공한다.

[HCP] Illuminating the Dark Host Cell Proteome: A host cell protein coverage method for LC-MS impurity assays.

2026-05-09 · Journal of pharmaceutical and biomedical analysis · 10.1016/j.jpba.2026.117555 · rel=0.766 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: DARK-COV 파이프라인을 통해 CHO, E. coli, HEK, Sf9 세포계에서 이론적으로 검출되지 않는 'Dark Host Cell Proteins'의 비율은 1.0-5.2%로 매우 낮았으며, 이는 >15,000건의 실험 데이터셋과 높은 일치도를 보여 LC-MS 기반 HCP 분석의 이론적 검출 한계를 정량화하고 규제적 정당성을 뒷받침하였다. 방법·데이터: LC-MS 기반 HCP 분석, HCPedia™ 데이터셋(>15,000 분석), CHO/E. coli/HEK/Sf9 세포계 검증필요: 15,000건 이상의 실험 데이터셋을 사용하여 in silico 예측(DARK-COV)과 실제 실험적 관측 간의 일치도가 통계적으로 유의미하게 높으며, 특히 검출되지 않는 단백질들이 실제로 위험도가 낮은 저분자 단백질임을 입증한 주장.

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

액체 크로마토그래피-질량 분석법(LC-MS)을 이용한 숙주 세포 단백질(HCP) 분석은 생물제제 제품의 개별 불순물을 동정하고 정량하여 위험 기반 불순물 평가를 지원한다. 그러나 효소면역측정법(ELISA) 방법과 달리, LC-MS 분석법의 방법 특이적 HCP 커버리지에 대한 체계적 평가는 아직 명확히 정의되지 않았다. 특히, 특정 분석 조건에서 본질적으로 검출이 불가능한 단백질에 대한 주의는 제한적이어서, 불순물 특성 규명에서 사각지대를 초래할 가능성이 있다. 본 연구에서는 LC-MS 기반 불순물 분석법의 이론적 HCP 커버리지를 평가하기 위한 투명하고 일반화 가능한 in silico 파이프라인인 DARK-COV를 제시한다. 이 파이프라인은 펩타이드 소수성, 전하 상태, 질량 대 전하 비를 기반으로 한 in silico 소화된 프로테오ーム의 물리화학적 필터링과 분석법 특이적 LC-MS 매개변수를 결합하여, 어떤 펩타이드와 단백질이 검출될 수 있는지 예측한다. 두 개 이상의 검출 가능한 펩타이드를 생성하지 않을 것으로 예측된 단백질은 다크 숙주 세포 단백질(Dark Host Cell Proteins)로 분류되었다. 이 파이프라인은 동일한 LC-MS 워크플로우를 사용하여 생성된 경험적으로 관찰된 HCP 펩타이드의 포괄적인 데이터베이스인 HCPedia™에 수집된 15,000건 이상의 LC-MS 분석에서 파생된 대규모 실험 데이터셋을 대상으로 벤치마킹되었다. 개념 증명 실증으로서, DARK-COV는 중국 햄스터 난소(CHO) 세포, 대장균(Escherichia coli), 인간 배아 신장(HEK) 세포, 그리고 밤나방속(Spodoptera frugiperda, Sf9) 세포를 포함한 네 가지 산업적으로 중요한 발현 시스템에 적용되었으며, 이상화된 in silico 조건 하에서 이러한 프로테오ーム에 있는 단백질 중 이론적으로 검출 불가능할 것으로 예측되는 비율은 1.0-5.2%에 불과함이 드러났다. 이러한 예측은 검출 가능성의 상한선을 제시하며, 실제 샘플에서의 매트릭스 효과, 이온 억제, 또는 농도 의존적 검출 가능성은 고려하지 않는다. >15,000건의 LC-MS 데이터셋에 걸친 실험적 관찰 결과와의 비교는 DARK-COV 예측과 강한 일치성을 보여주었으며, 이는 LC-MS 분석법의 검출 범위 밖으로 떨어질 가능성이 있는 단백질을 분류하는 것을 지지한다. 기능적 주석 달성과 알려진 고위험 HCP와의 비교는 대부분의 다크 숙주 세포 단백질이 생물제제 불순물 위험과 관련성이 낮은 저분자량 단백질임을 나타냈다. 전반적으로, 이 파이프라인은 LC-MS 분석법에서 이론적 커버리지를 정량화하고 예측을 실험적 관찰과 비교하기 위한 재현 가능하고 방법 특이적인 접근법을 제공한다. 분석적 사각지대를 식별함으로써, 이 전략은 미검출 HCP의 위험 기반 평가를 지원하며, USP Chapter 1132.1에 기술된 LC-MS 기반 HCP 불순물 분석의 규제적 정당화에 대한 합리적 기반을 제공한다. ⚠️[언어오염: 미정규화 토큰 ['ム']]

[HCP] Deep dive into drug substance HCP patterns for comprehensive safety assessment in recombinant mAb formats.

2026-07-07 · Biotechnology progress · 10.1002/btpr.88540 · rel=0.704 🔗 우리 도메인: proteomics/MS, antibody-topdown

핵심발견: CHO 세포 발현 재조합 mAb 5종에서 ND와 IAC 기법이 hexapeptide 기법보다 저 abundant HCP 검출을 확장하며, 두 기법은 상호 보완적임. 방법·데이터: LC-MS/MS 기반 HCP 분석, CHO 세포 발현 재조합 mAb 5종, hexapeptide enrichment, immunoaffinity chromatography (IAC), native digest (ND) 검증필요: ND와 IAC의 결합 적용이 polysorbate 안정성 문제 등 실제 공정에서 HCP 효소 활동으로 인한 안정성 저하를 해결하는 데 효과적임을 입증할 추가 데이터 필요

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

단클론항체(mAb) 치료제에서 공정 관련 불순물인 숙주 세포 단백질(HCPs)의 존재는 면역원성, 제품 불안정성 및 치료 효능 감소를 포함하는 위험을 제시한다. 따라서 HCP 수준은 모니터링이 필요한 중요한 품질 특성으로 간주된다. 프로젝트의 후기 단계, 제출 후 변경을 포함한 공정 변경 이후의 공정 개발 동안 잔류 HCPs의 특성 규명은 필수적이다. ELISA의 한계를 극복하기 위해, 특히 낮은 발현량의 개별 HCPs를 식별하는 데 있어 질량 분석법 기반의 HCPs 분석이 점점 더 많이 사용되고 있다. 본 연구에서는 CHO 세포에서 발현된 5가지 재조합 제품 전반에 걸쳐 낮은 발현량의 HCPs에 대한 LC-MS/MS 기반 검출을 향상시키기 위해 헥사펩타이드(enrichment), 면역친화 크로마토그래피(IAC), 그리고 자연 상태 소화(ND)의 세 가지 농축 전략을 체계적으로 비교하였다. 우리의 결과는 ND와 IAC 모두 총 HCP 식별 수에서 헥사펩타이드 농축 및 용액 내 소화(in-solution digest)를 넘어 HCP 검출을 상당히 확장시킨다는 것을 보여준다. IAC는 여러 잠재적으로 중요한 HCPs의 검출을 지원한 반면, ND는 항체 기반 방법으로는 포착되지 않은 추가적인 낮은 발현량의 HCPs를 고유하게 식별하였다. 또한 풀다운 검정(pull-down assays)은 활성 의약 성분(active pharmaceutical ingredient)과 상호작용할 가능성이 있는 제품 특이적 HCPs를 드러냈으며, 이는 표준 정제 단계가 이들의 제거에 불충분할 수 있음을 시사한다. 함께, 우리의 발견들은 심층적인 HCP 프로파일링을 위해 ND와 IAC의 상호 보완적 성격을 강조한다. 우리는 잠재적으로 중요한 HCPs의 포괄적인 검출을 보장하기 위해, 특히 효소 활성을 가진 HCPs로 인해 낮은 제품 또는 폴리에소르베이트(polysorbate) 불안정성 문제가 발생할 때 생물제제 제품에서 두 방법의 결합된 적용을 제안한다. 이러한 통합적 접근 방식은 향상된 제품 안전성과 공정 중 일관된 HCP 고갈의 관리를 지원한다.

[항체-topdown] Rapid and selective characterization of antibody-drug conjugates in complex sample matrices by native affinity liquid chromatography-mass spectrometry.

2026-01-18 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2618314 · rel=0.656 🔗 우리 도메인: proteomics/MS, antibody-topdown

핵심발견: POROS CaptureSelect FcXL 컬럼을 활용한 native affinity LC-MS(aLC-MS) 기법이 혈청 내 ADC의 DAR, DLD 및 상대적 약물 농도를 크로마토그래픽 피크 적분 없이 직접 및 고처리량으로 정량할 수 있음을 입증함. 방법·데이터: aLC-MS, POROS CaptureSelect FcXL, 마우스 혈청, 안정성 연구 및 농도 계열 분석 검증필요: 혈청과 PBS 간 ADC 생체전환 프로파일(말레이미드 가수분해 및 이황화물 교환)의 차이를 초록의 데이터만으로 어떻게 명확히 구분하고 정량화했는지

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

항체-약물 접합체(ADC) 및 기타 바이오의약품은 생물학적 매트릭스 내에서의 생체변환을 평가하기 위해 견고한 분석 방법이 필요하다. 현재의 접근 방식은 종종 오프라인 농축과 광범위한 크로마토그래피 분리를 필요로 하여 처리량을 제한하고 데이터 처리를 복잡하게 만든다. 우리는 POROS CaptureSelect FcXL 칼럼을 최적화된 용매 및 MS 매개변수와 결합하여 혈청과 같은 복잡한 샘플 매트릭스에서 ADC 및 기타 항체 유래 형식의 직접 분석(1D aLC-MS)을 가능하게 하는 네이티브 친화성 액체 크로마토그래피-질량 분석법(aLC-MS) 방법을 개발하였다. 이 방법은 마우스 혈청에서의 안정성 연구 및 농도 계열을 사용하여 평가되었다. 직접 분석은 크로마토그래피 피크 적분 없이 샘플 간 약물-항체 비율(DAR), 약물 부하 분포(DLD) 및 상대적 약물 풍부도를 정확하게 결정할 수 있게 해준다. 안정성 연구는 혈청과 PBS 간에 뚜렷한 ADC 생체변환 프로파일을 보여주었으며, 여기에는 과소접합된 시스테인 부위에서의 말레이미드 가수분해 및 이황화 결합 교환이 포함되었다. aLC-MS 방법은 혈청에서 125-2000 µg/mL 범위에서 우수한 직선성(R 2 =0.99)을 달성했으며 31.25 µg/mL까지 민감도를 보였다. 이 빠르고 선택적인 aLC-MS 방법은 최소한의 샘플 준비로 복잡한 매트릭스에서 ADC 품질 특성의 고속 모니터링을 가능하게 하여 바이오의약품 제품 개발 및 생체분석 응용을 지원한다. 이 방법은 오직 MS 결과에 기반하므로 데이터 처리 및 보고가 빠르고 자동화가 용이하다.

[중독] Neural, neurotransmitter, and molecular signatures of gray matter volume alterations in digital addiction.

2026-05-20 · Journal of psychiatric research · 10.1016/j.jpsychires.2026.05.027 · rel=0.617 🔗 우리 도메인: addiction-omics

핵심발견: 디지털 중독 환자에서 양측 전대상피질, 좌측 중전두회, 좌측 내측 안와전두피질의 회백질 용적 감소가 확인되었으며, 이는 세로토닌 및 GABA성 신경전달물질 시스템 및 시냅스 기능 관련 유전자 발현과 공간적 상관관계를 보였다. 방법·데이터: VBM 메타분석(SDM), Juspace를 이용한 신경전달물질 지도 공간 상관관계 분석, Allen Human Brain Atlas 기반 PLSR 유전자 풍부도 분석 검증필요: 초록에 없으면 '초록 미기재'

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

배경 및 목적 소셜 미디어, 게임, 스마트폰의 강박적 사용을 포함하는 디지털 중독(DA)은 신경생물학적 기반을 가진 행동 중독으로 점차 인식되고 있다. 그러나 신경영상 소견은 여전히 이질적이며, 관련 신경전달물질 및 분자 메커니즘은 명확하지 않다. 본 연구는 디지털 중독(DA)에서 일관된 회색질 용적(GMV) 변화를 규명하고, 이들의 신경전달물질 및 전사체 관련성을 탐색하는 것을 목적으로 하였다. 방법 디지털 중독(DA)군과 대조군 간 회색질 용적(GMV) 변화를 규명하기 위해 시드 기반 d 매핑(SDM)을 이용한 체적 기반 형태측정(VBM) 메타분석을 수행하였다. Juspace를 사용하여 GMV 변화와 규범적 신경전달물질 지도 간 공간 상관관계를 평가하였다. 알렌 인간 뇌 아틀라스(Allen Human Brain Atlas)를 사용하여 부분 최소제곱 회귀(PLSR)를 통한 전사체 해독을 수행한 후, 유전자 풍부도 분석 및 세포 유형 분석을 실시하였다. 결과 메타분석은 양측 전대상피질(ACC), 좌측 중전두회(MFG), 좌측 내측 안와전두피질(mOFC)에서 GMV 감소를 보였다. 이러한 영역은 세로토닌성 및 GABA성 시스템과 공간적으로 대응되었다. 전사체 분석은 시냅스 기능 및 이온 채널 활동에 풍부하게 관여하며, 주로 흥분성 및 억제성 뉴런에서 발현되는 GMV 변화와 연관된 534개의 유전자를 규명하였다. 결론 본 다중 규모 통합 분석은 디지털 중독(DA) 관련 GMV 변화를 특정 신경전달물질 시스템 및 유전자 발현 프로파일과 연관시킨다. 본 소견은 세로토닌성, 억제성, 그리고 보상 관련 신경생물학적 시스템의 관여에 대한 수렴적 증거를 제공하며, I-PACE 프레임워크 내에서 디지털 중독(DA)에 대한 보다 포괄적인 신경생물학적 이해에 기여할 수 있다.

[ADC] Trial watch: antibody-drug conjugates in cancer therapy.

2026-05-03 · Oncoimmunology · 10.1080/2162402x.2026.2667160 · rel=0.606 🔗 우리 도메인: tox-multiomics, antibody-topdown

핵심발견: ADC는 단클론항체의 표적 특이성과 소분자 약물의 세포독성 효력을 결합하여 혈액암 및 고형암에서 임상적 이득과 전반적 생존율 개선을 보였으며, 현재 정밀 종양학의 임상적으로 검증된 구성 요소로 자리 잡았다. 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: 초록에 기술된 '수많은 ADC 기반 요법의 임상 개발' 및 '다양한 종양 유형에서의 임상적 이득' 주장에 대한 구체적인 데이터셋 또는 코호트 정보가 누락되어 있어, 개별 ADC의 효능과 안전성 프로필을 비교·검증할 근거가 부족함.

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

항체-약물 접합체(ADC)는 단클론항체의 표적 특이성과 소분자 화합물의 세포독성 효능을 결합한다. 최근 몇 년간 ADC는 현대 정밀 종양학의 임상적으로 검증된 구성 요소로 부상했다. 현재까지 종양학적 적응증을 위해 12종 이상의 ADC가 FDA 승인을 받았으며, 추가적인 제제들이 지역적으로 승인되었고 수백 종의 ADC 기반 요법이 임상 개발 중이다. 집단적으로 이러한 치료법은 혈액학적 악성종양과 고형종양 전반에 걸쳐 임상적 이점을 입증했으며, 특히 후기 임상시험에서 진행성 질환에서 전체 생존율의 현저한 개선을 보였다. 본 Trial Watch에서는 초기 전임상 개발부터 현재 임상 적용에 이르기까지 이용 가능한 ADC에 대한 개요를 제공한다. 또한 에피토프 표적화, 링커 화학, 약물 독성 및 약물-항체 비율을 포함하여 임상적으로 성공적인 ADC를 뒷받침하는 설계 원칙을 요약하고, 이러한 특징들이 약동학, 세포내 이동, 사이드바이더 효과 및 독성에 어떻게 영향을 미칠 수 있는지 논의한다. 마지막으로, 향후 방향을 정의하기 위해 후기 단계 임상시험의 결과와 승인된 제제들의 결과를 논의한다.

[항체-topdown] Setting expectations for current and future directions of native mass spectrometry in the biopharmaceutical industry.

2026-07-15 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2699078 · rel=0.594 🔗 우리 도메인: proteomics/MS, antibody-topdown

핵심발견: 네이티브 질량분석법(native-MS)은 mAb, ADC 등 완전한 분자 복합체의 직접 평가를 통해 기존 분석법의 한계를 보완하지만, 처리량·민감성·자동화 등의 실용적 장벽으로 인해 산업계에서의 광범위한 채택은 제한적임 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: 네이티브 질량분석법의 산업 내 실제 적용 범위와 기존 직교 분석법(SEC, IEX 등) 대비 고유한 장점 및 한계가 명확히 정의되어 있는지

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

While native mass spectrometry (native-MS) has been widely explored in academic laboratories, its practical role within biopharmaceutical research remains less clearly defined. In this perspective, we present an industry-driven view of how native-MS is currently applied, where it offers unique advantages over established analytical technologies, and where alternative methods remain more practical for routine characterization. Within biopharma workflows, characterization strategies traditionally rely on orthogonal techniques such as size-exclusion chromatography (SEC), ion-exchange chromatography (IEX), electrophoresis, light scattering, calorimetry, and denaturing liquid chromatography (LC) MS. Native-MS complements these methods by enabling direct assessment of intact molecular assemblies, including monoclonal antibodies (mAbs), multispecific antibodies, antibody-drug conjugates (ADCs), glycoproteins, and protein complexes. Applications include evaluation of higher-order assembly, ligand or cofactor binding, stoichiometry of target complexes, and heterogeneity that may be obscured under denaturing conditions. However, challenges related to throughput, sensitivity, automation, and accessibility have limited widespread adoption in industrial laboratories. Emerging developments, including chromatographic hyphenation, online buffer exchange (OBE), improved automation, and charge-detection MS (CDMS), are beginning to address these constraints. We argue that the future impact of native-MS in biopharma will depend on integrating these technological advances with platformed analytical workflows and software capable of supporting high-throughput characterization across therapeutic pipelines. We hope that the ideas raised in this article spur debate on when, how, and if native-MS would or should see increased adoption.

[ADC] Multi-modal feature learning to prioritize ADCs with favorable half-life in mice.

2026-04-17 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2657646 · rel=0.592 🔗 우리 도메인: antibody-topdown

핵심발견: XGBoost 기반 다중 모달 학습 프레임워크는 항체 서열, AlphaFold 구조, 단백질 언어 모델 임베딩을 결합하여 C57BL/6 마우스 내 mAb 및 ADC의 반감기를 정량적으로 예측하며, 구조 기반 및 PLM 접근법이 시퀀스 단일 모델보다 우수한 성능(Pearson's r=0.76~0.79)을 보였다. 방법·데이터: 실험적 반감기 데이터 118건(mAb 및 ADC), C57BL/6 마우스, XGBoost 모델, AlphaFold, 단백질 언어 모델(PLM), ESM-2 검증필요: 시퀀스 기반 모델 대비 구조 기반 및 PLM 모델의 우월성이 항체 서열 정보 자체의 품질 차이 때문인지, 아니면 실제 3차원 구조/임베딩 정보가 추가적인 예측력을 제공하는지 분리하여 검증 필요

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

항체-약물 접합체(ADC)의 유리한 약동학(PK) 특성은 더 높은 전신 노출을 가능하게 하며 개선된 임상 효능과 관련이 있으나, ADC의 PK 최적화는 여전히 주로 경험적이며 자원이 많이 소요된다. 우리는 다중 모달 특징 학습을 사용하여 C57BL/6 마우스에서 단클론 항체(mAb)와 ADC의 반감기를 예측하기 위한 in silico 프레임워크를 개발하였다. ADC의 구조적 복잡성을 다루기 위해 각 화합물은 세 가지 구성 요소로 분해되었다: (1) 서열 설명자, AlphaFold 기반 구조적 특성 또는 단백질 언어 모델(PLM) 임베딩으로 표현된 항체 특징; (2) 약물-항체 비율 및 접합 부위를 포함한 접합 관련 특징; (3) 링커-페이로드의 물리화학적 특성. 118개 mAb 및 ADC의 실험적 반감기 데이터를 사용하여 XGBoost 모델이 훈련되었다. 구조 기반 및 PLM 접근법은 강력한 교차검증(Pearson의 r = 0.76)을 달성하여 서열 전용 모델보다 우수한 성능을 보였다. 32개 mAb 및 ADC의 시간적 검증에서 구조 기반 모델은 견고한 일반화(r = 0.79)를 입증하였다. PLM 임베딩은 비교 가능한 순위 매기기(Spearman의 ρ, ESM-2의 경우 최대 0.81)를 달성하였으나 구조 기반 모델에 비해 정량적 정확도는 낮았다. 전반적으로 본 연구는 합성 및 in vivo 시험 전에 mAb 및 ADC의 초기 PK 선별을 위한 확장 가능한 머신러닝 프레임워크를 제시한다.

[항체-topdown] Glycan pairing in therapeutic IgG orchestrates Fcγ receptor engagement and ADCC: an integrated structure-function approach for thorough evaluation of Fc N-glycans as critical quality attributes.

2026-04-02 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2652642 · rel=0.59 🔗 우리 도메인: tox-multiomics, antibody-topdown

핵심발견: 리툭시맙을 모델로 한 정제된 대칭/비대칭 당 사슬 변이체 분석 결과, 단일 비핵당화(afucosylation)가 FcγRIIIa 결합 및 ADCC 효능을 최대화하는 주요 인자였으며, 갈락토실화 및 고만노스 종은 수용체 및 대립유전자에 따라 미미하거나 문맥 의존적인 효과를 보였다. 방법·데이터: 리툭시맙 모델 IgG, 제어된 효소화학적 재구성(chemoenzymatic remodeling)으로 생성된 순수 대칭/비대칭 Fc 당 사슬 변이체, 표면 플라즈몬 공명(SPR)을 통한 인간 FcγR(FcγRI, FcγRIIa-H131/R131, FcγRIIIa, FcγRIIIb) 결합 분석, 세포 기반 ADCC 리포터 유전자 검정. 검증필요: FcγRIIa-H131이 갈락토실화에, FcγRIIa-R131이 비핵당화에 의해 주로 조절된다는 수용체 및 대립유전자 특이적 결합 차이의 정량적 재현성 및 생물학적 타당성.

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): ⚠️하이프-언어(과장 소지)

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Monoclonal antibodies (mAbs) can mediate their therapeutic activity through antigen binding and by engaging Fc receptors (FcRs) or the complement system. FcRs are expressed on immune cells and can initiate effector functions such as antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) and antibody-dependent cellular phagocytosis. The conserved Fc N-glycans of immunoglobulin G (IgG) at N297 modulate the strength and stability of Fc-FcγR interactions and the resulting effector responses. Conventional analysis typically considers individual glycans in isolation and neglects the fact that each Fc part carries two N-glycans, that may be paired symmetrically or asymmetrically. Recent studies with IgG Fc regions have demonstrated that glycan pairing can significantly shape Fc-FcR interactions. Here, the effect of glycan pairing was evaluated with full-length IgG using rituximab as a model. A set of pure, homogeneous, symmetrical, and asymmetrical Fc glyco-pair variants was generated by controlled chemoenzymatic remodeling and purification. Surface plasmon resonance binding studies across a comprehensive panel of human FcγRs revealed receptor- and allotype-specific effects: FcγRI binding was essentially unaffected, FcγRIIa showed allotype dependence, with FcγRIIa-H131 predominantly modulated by galactosylation and FcγRIIa-R131 by afucosylation, whereas FcγRIIIa required only a single afucosylation to reach maximal binding. Galactosylation exerted modest and receptor-dependent effects, most pronounced for FcγRIIIb. High-mannose species reduced binding to FcγRI and FcγRII, but displayed intermediate affinity to FcγRIIIa, which was lower than afucosylated complex types yet higher than fully fucosylated variants. To evaluate the biological relevance, cell-based ADCC reporter gene assays confirmed that single afucosylation was sufficient to drive the increase in ADCC potency, with galactosylation and high-mannose contributing only modest or context-dependent effects. Together, these findings establish glycan pairing as a critical quality attribute of therapeutic antibodies and provide a framework for precise evaluation of Fc N-glycan criticality and for tailoring mAbs with defined effector function profiles.

[프로테오지노믹스] Integrated proteogenomic profiling reveals coordinated differential expression signatures during neuroinflammation.

2026-07-10 · Acta neuropathologica communications · 10.1186/s40478-026-02365-0 · rel=0.574 🔬 공개데이터: GEO:GSE330115, PRIDE:PXD078146 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: EAE 마우스 척추에서 RNA-seq와 LC-MS/MS를 결합한 심층 프로테오제노믹 분석 결과, 선천성 및 적응성 면역 반응 관련 유전자 발현이 상향 조절되는 반면, 신경원, 시냅스, 미토콘드리아 경로는 하향 조절되어 전사체와 단백질체 수준에서 높은 일치도(Rp=0.867)를 보였다. 방법·데이터: RNA-seq (GEO, GSE330115), LC-MS/MS (PRIDE, PXD078146), EAE 유도 마우스 척추 조직 검증필요: 전사체(RNA)와 단백질체 데이터 간의 높은 상관관계(Rp=0.867)가 통계적 유의성 검증 및 생물학적 재현성을 갖춘 신뢰할 수 있는 결과인지 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 초록에 기술된 통계값 'R p = 0.867'에서 'p'가 상관관계 계수(R)의 일부로 표기되었는지, 아니면 p-value를 의미하는지 명확하지 않아 통계적 표기법에 대한 의문 발생

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

배경 실험적 자가면역 뇌척수염(EAE)은 자가면역 신경염증의 주요 모델이지만, 중추신경계(CNS)의 전사체 및 프로테오믹스 이상 조절에 대한 통합적 특성 규명은 누락되어 있었다. 방법 본 연구에서는 RNA-seq(GEO, GSE330115)과 LC-MS/MS(PRIDE, PXD078146)을 결합하여 급성 질환기 EAE 유도 마우스의 척추에서 심층 프로테오게놈학적 프로파일링을 수행하였다. 결과 우리는 선천성 및 적응성 면역 반응 시그니처의 광범위한 상향 조절과 함께 신경, 시냅스 및 미토콘드리아 경로의 조화로운 하향 조절을 확인하였다. 신경염증 모델을 다루는 기존 연구에서 보고된 대로 예상되는 차이에도 불구하고, log₂ fold changes 및 경로 풍부도 점수는 두 유전자 산물 수준 간 높은 일치도를 보였다(R p = 0.867, p < 0.001). 결론적으로, 이 통합 데이터셋은 신경염증에서 조정된 다층 분자 재구성을 드러내며, 마우스의 염증성 중추신경계 조직에서 바이오마커 기원의 기전적 해석을 정교화한다.

[DAR] An intrinsically hydrophilic linker enables a stable, high-DAR exatecan-based HER2 ADC with potent antitumor activity.

2026-06-10 · European journal of medicinal chemistry · 10.1016/j.ejmech.2026.119054 · rel=0.562 🔗 우리 도메인: tox-multiomics, antibody-topdown

핵심발견: 친수성 링커(SMP-70067-L)를 활용한 고DAR(7.92) HER2-ADC(SMP-70067-X)는 DS-8201a 대비 낮은 응집도와 HER2-moderate/low xenograft 모델에서 향상된 항종양 효능을 보임. 방법·데이터: ADC 설계 및 평가(체외/체내 xenograft 모델). 초록 미기재 검증필요: SMP-70067-X가 DS-8201a 대비 HER2-moderate 및 HER2-low xenograft 모델에서 유의미하게 향상된 항종양 효능을 보이는지.

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Antibody-drug conjugates (ADCs) combine the targeting specificity of monoclonal antibodies with the potent cytotoxicity of small-molecule drugs. However, ADC development using Exatecan, a potent topoisomerase I inhibitor, has been challenged by its hydrophobicity, leading to aggregation, rapid clearance, and off-target toxicity. Herein, we report the design of an intrinsically hydrophilic drug-linker platform (SMP-70067-L) that enables the construction of a homogeneous Exatecan-based HER2-targeted ADC (SMP-70067-X) with a high drug-to-antibody ratio (DAR of 7.92). Similar to Trastuzumab deruxtecan (DS-8201a), which achieves high DAR without PEG or polysarcosine chains through a hydrophilic self-immolative spacer, SMP-70067-L integrates minimal hydrophilic elements, including a glutamic acid residue and a modified aromatic self-immolative spacer, to balance hydrophilicity, stability, and efficient payload release. The resulting ADC exhibits low aggregation ( 50 values) and significantly enhanced antitumor efficacy compared to DS-8201a in HER2-moderate and HER2-low xenograft models. These results highlight the critical role of rational linker engineering in expanding the therapeutic window of hydrophobic topoisomerase I inhibitor-based ADCs.

[ADC] Targeting IL-7Rα with PNU-159682 antibody-drug conjugates in acute lymphoblastic leukemia: translational implications.

2026-04-27 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2663639 · rel=0.56 🔗 우리 도메인: antibody-topdown

핵심발견: DNA 손상제 PNU-159682를 탑재한 IL-7Rα 표적 항체-약물 접합체(577-PNU)는 MMAE 접합체 대비 50배 이상 강력한 효능을 보였으며, 예방 및 치료 모델 모두에서 뇌와 척수 침윤을 포함한 백혈병의 완전한 종양 퇴피와 내구성 있는 질병 통제를 달성하고 안전성을 입증했다. 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: 577-PNU가 예방 및 확립된 뇌척수액(CNS) 백혈병 모델에서 실제로 완전한 종양 퇴피(complete tumor regression)와 내구성 있는 질병 통제를 유도한다는 전임상 효능 데이터의 재현성

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Relapsed acute lymphoblastic leukemia (ALL), particularly with central nervous system (CNS) involvement, remains a major cause of treatment failure and is inadequately controlled by existing antibody-drug conjugates (ADCs) with tubulin inhibitors. To address this limitation, we developed IL-7Rα-targeted monoclonal antibodies and identified clone 577 as the lead candidate. Using this antibody, we generated ADCs conjugated with either monomethyl auristatin E (MMAE) or the highly potent DNA-damaging payload-PNU-159682 (PNU). In head-to-head comparisons, 577-PNU showed >50-fold greater potency than 577-MMAE in vitro and induced complete tumor regression in xenografts at a 20-fold lower dose. Additionally, 577-PNU provided durable systemic disease control and markedly reduced leukemic infiltration in the brain and spinal cord in both preventive and established murine CNS disease models, offering direct evidence of effective CNS penetration. Safety assessments demonstrated stable body weight, normal hematology and serum biochemistry, and no treatment-related pathologies. Collectively, these findings provide the first preclinical evidence that IL-7Rα-directed ADCs armed with DNA-targeting payload PNU-159682 can achieve durable elimination of systemic and CNS leukemia at tolerable doses, demonstrating both clinical feasibility and CNS disease control, and establishing a compelling rationale for their translational and clinical development in relapsed and refractory ALL.

[희귀질환] Parents' experiences of diagnosis and specialist care of children's rare birthmarks.

2026-09-01 · British journal of health psychology · 10.1111/bjhp.70095 · rel=0.557 🔗 우리 도메인: rare-disease

핵심발견: 희귀한 심각한 선천성 반점을 가진 자녀를 둔 부모는 진단 및 전문 의료 서비스 접근 과정에서 '첫 방문 전 경험', '의료 시스템 내 소속감 형성(learning to belong)', '질환 수용(making room)'이라는 3가지 주요 과제를 겪으며, 전문 센터의 역할이 부모의 적응에 핵심적임. 방법·데이터: 반구조화된 서사형 인터뷰(NVivo 13 사용), 23명(영국 런던 소재 NHSE 희귀질환 협력 네트워크(RDCN) 외래 클리닉에서 순차적 모집, 자녀 연령 ≤12세), 반성적 주제 분석(RTA). 검증필요: 전문 의료 서비스의 질적 경험과 부모의 심리적 적응 간의 인과적 또는 상관적 연결 고리가 질적 데이터(인터뷰 내용)를 통해 어떻게 구체적으로 입증되었는지에 대한 근거.

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Objectives Congenital melanocytic naevi (CMN) and arteriovenous malformations (AVM) are rare, severe and incurable birthmark conditions associated with lifelong visible difference and complex medical needs. Despite the importance of early health care experiences for parental and child adjustment in general, these remain unexplored in this context. This study aimed to explore parental experiences of raising a child with rare severe birthmarks, the role of specialist care in parental adjustment, and to develop recommendations for clinical care. Design Reflective thematic analysis (RTA) was used to analyse semi-structured narrative-style interviews conducted with 23 parents of children aged ≤12 years recruited sequentially from a specialized NHSE Rare Disease Collaborative Network (RDCN) outpatient clinic in London, UK. Methods Interviews were conducted virtually via telephone or Zoom and analysed using RTA using NVivo software (version 13). Reflexivity was achieved through the keeping of a reflexive journal and debriefing with the research team. Results Through RTA, three themes were generated which highlight the challenges faced by parents of children with rare birthmarks. Firstly, parents' experiences before coming to the first appointment, secondly 'learning to belong' in the health care system and thirdly 'making room' for the condition. These themes and respective subthemes provide new insights into the importance of specialist centres in relation to parental adjustment to rare birthmarks. Conclusions Findings underscore the pivotal role of specialist care in parental adjustment to rare, appearance-altering conditions. Practical care recommendations are presented to support families across care pathways.

[프로테오지노믹스] Multiomics combined with machine learning defines unique molecular subtypes of cholangiocarcinoma and identifies TNK1 as a therapeutic target.

2025-09-29 · Hepatology (Baltimore, Md.) · 10.1097/hep.0000000000001535 · rel=0.53 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: 전장 엑솜, mRNA, 단백질/인산화체 분석과 머신러닝을 통해 CCA의 3개 분자 하위군(면역조절, 대사, 유전자조절/세포 운명)을 규명했으며, 대사 하위군에서 TNK1이 치료 표적으로 확인되어 TP-5801 투여 시 종양 성장이 억제되었다. 방법·데이터: 전장 엑솜 시퀀싱(WES), mRNA 시퀀싱, 단백질체/인산화체 분석; 공개데이터셋명 미기재 검증필요: 공개 데이터셋을 활용한 클러스터 매핑 및 생존 분석의 재현성

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

배경 및 목적 담도암(CCA)은 분자적 이질성과 치료 저항성을 특징으로 하는 가장 치명적인 암 중 하나이다. 새로운 생물학적 신호와 치료 기회를 규명하기 위해 우리는 머신러닝과 결합된 다오믹스(multiomic) 특성 분석을 활용하였다. 접근법 및 결과 우리는 전장 엑솜 시퀀싱, mRNA 시퀀싱, 그리고 프로테오믹스/인산프로테오믹스 분석을 사용하여 모든 해부학적 CCA 아형을 프로파일링하였다. 통합 차원 축소는 종양 이질성을 주도하는 RNA, 단백질 및 인산단백질 특징을 드러내어 클러스터링을 가능하게 하였다. 머신러닝 알고리즘은 각 클러스터의 분자적 특징을 식별하고 외부 데이터셋 및 환자 유래 이식 모델(PDX)을 이러한 클러스터에 매핑하였다. 키나아제 풍부화 분석은 각 클러스터에서 활성인 표적화 가능한 키나아제를 강조하였다. 클러스터 특이적 PDX 모델에서 선택적 TNK1 억제제인 TP-5801을 사용하여 생체 내 검증이 수행되었다. 우리는 서로 다른 경로 특징을 가진 3개의 분자 클러스터를 식별하였다: 면역조절(클러스터 1), 대사(클러스터 2), 그리고 유전자 조절/세포 운명(클러스터 3). 클러스터 할당은 해부학적 아형과 무관하였으나, 치료 목적의 절제술 이후 전체 생존율과 상관관계가 있었다. 또한 우리는 환자 치료 선택에 중요한 전체 생존율 및 림프절 전이와 연관된 다오믹스 특징과 경로를 식별하였다. 키나아제 풍부화 분석은 대사 클러스터에서 TNK1이 매우 활성인 키나아제임을 지목하였다. TP-5801로 치료한 결과, 대사 PDX 모델에서는 종양 성장이 현저히 감소하였으나, 다른 클러스터를 대표하는 모델에서는 감소하지 않았다. 내부 데이터와 공개적으로 이용 가능한 데이터셋을 결합하여, 우리는 면역조절 클러스터가 gemcitabine/cisplatin 치료에 가장 민감함을 식별하였으며, 이는 클러스터 특이적 PDX 모델을 사용하여 생체 내로 확인되었다. 결론 통합된 다오믹스 특성 분석은 치료 반응과 전체 임상 결과 모두와 연관된 고유한 분자 아형을 정의함으로써 번역적 통찰력을 제공한다. 이 접근법은 TNK1을 정의된 하위 집단의 CCA 종양에서 이전에 인식되지 않았던 치료 표적으로 식별하였다.

[프로테오지노믹스] Application of Proteogenomic Approaches for Refinement of the Entamoeba histolytica Reference Genome Using High Resolution Mass-Spectrometry Data.

2026-07-20 · Acta parasitologica · 10.1007/s11686-026-01352-8 · rel=0.524 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: 공개된 고해상도 질량분석 데이터와 커스텀 6-frame 번역 게놈 데이터베이스를 비교 검색하여, 기존 참조 단백질 데이터베이스에 매핑되지 않는 480개의 게놈 검색 특이 펩타이드(GSSP)를 식별하고 이를 통해 41개의 신규 단백질 코딩 유전자를 확인했으며 18개 유전자의 주석을 수정하였다. 방법·데이터: 단백질체학; Entamoeba histolytica HM-1:IMSS trophozoites; 공개 데이터셋(Proteome Discoverer suite, 1% FDR 기준) 검증필요: 41개의 신규 유전자와 18개 수정 유전자가 실제 생물학적 기능(예: TLDc 도메인, rhomboid peptidase)을 가지며 병원성 기전에 기여하는지 실험적 검증 여부

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Purpose Entamoeba histolytica is the causative agent of amoebiasis or amoebic dysentery, remains a significant global health burden, particularly in regions with inadequate sanitation. Despite the availability of a reference genome, a substantial proportion of predicted genes remain annotated as hypothetical proteins or lack experimental validation. Limitations inherent to automated gene prediction pipelines along with the parasite's highly AT-rich, repetitive genome architecture have resulted in numerous coding regions unresolved, underscoring the need for experimental approaches to refine genome annotation. Methods We undertook a comprehensive proteogenomic analysis by searching publicly available high-resolution proteomic datasets from E. histolytica HM-1:IMSS trophozoites against a custom six-frame translated genome database. The proteomic data was searched using Proteome Discoverer suite at 1% false discovery rate. Results Many unique peptides were identified during database dependent searches and of these, 480 peptides did not map to the reference protein database and were referred to as genome search-specific peptides (GSSPs). Mapping these GSSPs to the genome supported the identification of 41 novel protein-coding genes and corrected annotation of 18 currently annotated genes. Conserved domain analysis revealed that 78% of novel proteins harboured identifiable functional domains, including TLDc domain-containing proteins and rhomboid peptidase family proteins. Comparative analysis confirmed conserved orthologs across related Entamoeba species. Conclusion This is the first study to demonstrate proteogenomic integration of peptide-level evidence with genomic data substantially improves genome annotation in E. histolytica, expanding its known coding repertoire and providing functional insights into previously uncharacterized regions with implications for understanding parasite biology and virulence mechanisms.

[중독] Region- and sex-dependent single-cell transcriptomic signatures of neurons and glia in the prefrontal cortex and nucleus accumbens in a rat model of alcohol relapse.

2026-04-27 · Neuropharmacology · 10.1016/j.neuropharm.2026.110995 · rel=0.52 🔗 우리 도메인: addiction-omics

핵심발견: 알코올 금단 효과(ADE) 모델에서 고음주 쥐의 중추신경계 회로(NAcc GABAergic MSNs 및 mPFC glutamatergic neurons)에서 현저한 전사체 변화가 관찰되었으며, 이는 도파민 수용체, 인산다이에스테라아제, 시냅스 가소성 및 신경면역 관련 유전자에서 성별 및 뇌 영역에 따라 다르게 나타남. 방법·데이터: snRNA-seq, RccHan Wistar outbred rats (male/female), Alcohol Deprivation Effect (ADE) paradigm, medial prefrontal cortex (mPFC) 및 nucleus accumbens (NAcc) 검증필요: 고음주 쥐와 저음주 쥐 간 비교에서 NAcc GABAergic MSNs와 mPFC glutamatergic neurons에서 가장 많은 발현 차이를 보인 유전자들이 실제로 알코올 재발 마커로 기능하는지, 그리고 성별/영역 의존적 변화의 생물학적 인과관계 검증

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Alcohol use disorder (AUD) is characterized by problems controlling alcohol drinking despite adverse consequences, development of tolerance and/or withdrawal symptoms. Notably, sex differences in alcohol consumption patterns and susceptibility to relapse are well documented but remain poorly understood at the molecular level. In this study, we performed single-nuclei RNA sequencing (snRNA-seq) of the medial prefrontal cortex (mPFC) and nucleus accumbens (NAcc) from male and female outbred RccHan Wistar rats exposed to the alcohol deprivation effect (ADE) paradigm, a well-established model of relapse-like drinking behaviour. Comparing high-to low-drinking rats, we found pronounced transcriptional changes across different cell types, with the highest number of differentially expressed genes observed in GABAergic medium spiny neurons (MSNs) of the NAcc and glutamatergic neurons of the mPFC associated with relapse. Importantly, we also identified sex- and region-dependent transcriptional alterations, including differential expression of dopamine receptors and phosphodiesterase family genes, which have previously been associated with AUD in humans, as well as alterations in the transcription of genes associated with synaptic plasticity and neuroimmune signalling. Finally, we found induction of immune-related genes in microglia and sex-dependent activation of immune- and myelination-related genes in astrocytes and oligodendrocytes. These findings highlight cell type-, region-, and sex-dependent molecular signatures associated with alcohol relapse drinking, which may provide new therapeutic targets for AUD.

[PTM] Ovalbumin oxidative modification fingerprints depend on gas plasma-driven reactive species profiles.

2026-06-17 · Redox report : communications in free radical research · 10.1080/13510002.2026.2688623 · rel=0.51 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: 고해상도 질량분석을 통해 80종 이상의 산화 변형이 아미노산 수준에서 매핑되었으며, 원자 산소와 과산화수소가 단백질 산화의 주요 인자로 확인되었다. 방법·데이터: 고해상도 질량분석(High-resolution mass spectrometry), 닭 난백 오발부민(Ovalbumin), 12종 아르곤 가스 플라즈마(수분, 에탄올, 산소, 질소 첨가 변형) 검증필요: 원자 산소와 과산화수소의 관여를 입증한 상관분석의 통계적 유의성 및 인과관계 방향성 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 초록에 특정 변형(Trp149, Met274)이 특정 라디칼(수소 라디칼 등)과 직접 연결된 인과적 기전 설명이 부족하며, 상관분석 결과를 인과관계로 단정하는 논리적 비약 가능성

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Objective Oxidative protein modifications have been linked to several diseases, but the variety and diversity of modifications are less studied. Methods We used the chicken egg protein ovalbumin and gas plasma technology, a potent source of various reactive species, for protein oxidation. Using high-resolution mass spectrometry and an in-house workflow, over 80 distinct oxidative protein modifications were mapped at per-amino-acid resolution. To examine how modification profiles depend on changes in reactive species types and concentrations, we generated 12 distinct argon gas plasmas by systematically varying molecular gas admixtures (water, ethanol, oxygen, and nitrogen). Results Optical emission spectroscopy (OES) and photometric determination of deposited long-lived species (hydrogen peroxide, nitrite, and nitrate) were applied to profile gas plasma conditions, revealing the admixture-dependent impact on the reactive oxygen/nitrogen species (ROS/RNS) fingerprint. Correlation analysis with mass spectrometry data revealed the significant involvement of atomic oxygen and hydrogen peroxide in protein oxidation. The enrichment of specific reactive species created by a defined gas plasma composition generated specific ovalbumin oxidation profiles resolved per amino acid. Feed gas-dependent oxidation hotspots, such as Trp149 for dry argon gas or Met274 for hydroxyl radical-rich humidified argon gas, were identified. Discussion This first-of-its-kind study reveals intricate relationships between dynamic reactive species environments and protein oxidation profiles using ovalbumin as a model system.

[DAR] Programmed death 1 antibody drug conjugates (PD 1 ADCs): Innovations in overcoming resistance and enhancing immune mediated antitumor activity.

2026-06-11 · Translational oncology · 10.1016/j.tranon.2026.102830 · rel=0.501 🔗 우리 도메인: tox-multiomics, antibody-topdown

핵심발견: PD-1 항체-약물 접합체(ADC)는 종양 미세환경 내 PD-1 발현 세포를 표적하여 세포독성 약물을 전달하고 T 세포 고갈을 회복시키며, 기존 PD-1 억제제의 저항성을 극복하기 위한 이중 기전적 접근법으로 개발되고 있다. 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: 종양 항원의 이질성, 저항성 기전 발생, ADC 링커 불안정성이라는 주요 개발 장애요인을 해결하기 위한 ADC 공학 개선 및 세포독성 페이로이드 최적화의 구체적 전략과 임상적 효능 증대 증거

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Programmed death-1 (PD-1) antibody-drug conjugates (ADCs) are a new generation of immune checkpoint blockers, which incorporate the delivery of cytotoxic drug targets. The objectives of these ADCs are to selectively target cells in the tumor microenvironment expressing PD-1, causing tumor cells to die, rejuvenating T cell exhaustion, and destroying immunosuppressive cells. PD-1 ADCs aim to address the shortcomings of conventional PD-1 inhibitors, which may be resistant in certain cancers, by harnessing a two-pronged mechanism. This method can also be used to boost antitumor immunity by stimulating the activation and expansion of immune effector cells. Despite promising preclinical and early clinical outcomes, multiple issues remain in the development of PD-1 ADCs, including heterogeneity in tumor antigens, the development of resistance mechanisms, and instability of the ADC linker. Current studies are trying to overcome these challenges by improving ADC engineering, cytotoxic payload optimization, and investigating combination therapy. PD-1 ADCs, with their capacity to specifically regulate immunity and deliver potent cytotoxic drugs directly to tumor cells, have the potential to provide a valuable treatment modality. This would be beneficial for clinical outcomes, especially in cancers resistant to traditional treatment methods, and it represents a great step forward in cancer immunotherapy.

[신경과학·뇌질환] Beyond the gut: the multisite microbiota and its emerging role in brain health.

2026-07-09 · Gut microbes · 10.1080/19490976.2026.2702091 · rel=0.5 🔗 우리 도메인: neurodegeneration

핵심발견: 구강, 피부, 호흡기, 비뇨생식기 등 비장내 미생물군집도 면역 신호, 대사산물, 장벽 무결성 및 신경 경로를 통해 뇌 건강과 신경염증, 신경퇴행성 질환에 영향을 미칠 수 있음을 시사하며, 장 중심적 접근을 넘어 다중 부위 통합적 연구가 필요함을 강조함 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: 비장내 미생물군집과 뇌 건강 간의 인과관계가 아직 입증되지 않았으며 기전적 통찰이 제한적이라는 점

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

The human microbiota encompasses diverse microbial communities inhabiting the gut, oral cavity, skin, respiratory tract, and urogenital system, each contributing uniquely to host physiology and health. While the gut microbiota has been extensively studied in the context of brain development and behavior through the microbiota-gut-brain axis, emerging evidence highlights that non-gut microbial ecosystems also shape neuroimmune processes and neurological outcomes. However, evidence supporting non-gut microbiota-brain interactions remains heterogeneous and is often indirect, with causal relationships largely unproven. A growing biological plausibility suggests that oral, skin, nasal, respiratory, and urogenital microbiota influence brain health through immune signaling, microbial metabolites, barrier integrity, and even direct neural pathways. This evidence is derived from a combination of human observational and epidemiological studies, complemented by mechanistic insights from animal models and in vitro systems. Microbial imbalance at these sites has been linked to neuroinflammation, neurodevelopmental alterations, and neurodegenerative diseases, although mechanistic insight remains limited. Moreover, cross-talk between different microbial niches may amplify or mitigate neurological effects, indicating the need for integrative, multi-site, and multi-omics approaches. By critically synthesizing evidence across multiple body sites, this mini-review highlights conceptual gaps, and the need to move beyond a gut-centric framework toward integrative, multisite investigations of microbiota-brain communication.

[DAR] Antibodies to watch in 2026. 🔁멀티도메인구제

2026-01-21 · mAbs · 10.1080/19420862.2026.2614669 · rel=0.495 🔗 우리 도메인: antibody-topdown

핵심발견: 2025년 첫 시장 승인된 항체 치료제 19종과 규제 검토 중인 26종을 요약했으며, 후기 임상 단계 파이프라인의 76%가 비암 indication이고 62%가 conventional format임을 확인했다. 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: 중국산 항체 치료제의 개발 및 승인 기간이 평균적으로 더 짧다는 주장의 통계적 근거 및 편향 가능성

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

The Antibodies to Watch article series provides annual updates on commercial late-stage clinical development, regulatory review, and marketing approvals of antibody therapeutics. Since the first article was published in 2010, the late-stage pipeline has grown from 26 antibody therapeutics to over 200, while during the same time numerous molecules in late-stage studies either transitioned to regulatory review and were approved or were terminated. In this installment of the series, we recap first marketing approvals granted to 19 antibody therapeutics in 2025, discuss 26 molecules currently in regulatory review, including the bispecific antibody-drug conjugate izalontamab brengitecan, and predict which molecules of the 209 currently in the commercial late-stage pipeline might transition to regulatory review by the end of 2026. Most antibody therapeutics in the latter category are for non-cancer indications (16/21, 76%) and have a conventional format (13/21, 62%), but the category also includes numerous antibody-oligo or -drug conjugates, such as delpacibart etedesiran, delpacibart zotadirsen, zeleciment rostudirsen, sonesitatug vedotin, trastuzumab pamirtecan, and ifinatamab deruxtecan, as well as the bispecific petosemtamab. As antibody therapeutics development is a global enterprise, we also discuss trends in annual first approvals granted to antibody therapeutics in any country since 2010, stratified by the antibody's country of origin, documenting the notable increases in the total number of first approvals and those approved first in China. Finally, to benchmark the time typically required for clinical development and regulatory review, we calculated this period for recently approved antibody therapeutic products stratified by their therapeutic area, mechanism of action, format, and country of origin. Our data show that the development and approval period were typically ~6 years, but on average this period was shorter for China-originated products.

[프로테오믹스] Dysregulated proteins in plasma distinguishing Loeys-Dietz syndrome from other heritable thoracic aortic disease - an explorative study. 🔁멀티도메인구제

2026-07-18 · Scandinavian cardiovascular journal : SCJ · 10.1080/14017431.2026.2699504 · rel=0.489 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: LDS 환자군에서 Oncostatin M, Pentraxin 3, TNFRSF9, GNLY, CD5, Vasorin, GP1BA의 혈장 단백질 수치가 건강 대조군에 비해 유의하게 높았으며, 이는 Th17 및 혈소판 관련 기전과 연관됨. 방법·데이터: 표적 프로테오믹스(Immunoaffinity proteomics, 276 단백질 분석), LDS(n=8), MFS(n=11), ACTA2 변이 TAA(n=7), 건강 대조군(n=16). 검증필요: LDS 특이적 단백질 발현 증가가 Th17 및 혈소판 기전과 인과적으로 연관되어 있으며, HTAD 내 LDS를 구별하는 신뢰할 만한 바이오마커로 기능할 수 있는지. 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 매우 작은 표본 크기(LDS n=8)에서 다중 검정 보정 없이 또는 제한된 보정만으로 '유의함'을 주장한 점. 특히 MFS 및 ACTA2 변이군과의 직접적인 비교보다는 건강 대조군과의 비교에 의존하여 LDS의 '특이성'을 단정지은 것은 통계적 검정력이 부족하여 위양성 가능성이 높음

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Objectives. Thoracic aortic aneurysms (TAAs) are often found in younger individuals and approximately 20% may be associated with heritable thoracic aortic disease (HTAD). There are some data on genomic biomarkers reflecting inflammation and extracellular matrix remodelling in HTAD. However, data that accurately reflect the corresponding protein changes are scarce. Our aim was to quantify proteins by using targeted proteomics in HTAD patients versus healthy controls, to better understand the underlying pathophysiology. Methods . Patients with Loeys-Dietz syndrome (LDS, n  = 8), Marfan syndrome (MFS, n  = 11), and familial TAA 6, i.e. actin alpha 2 (ACTA2, n  = 7) pathogenic variants were recruited at our outpatient clinic. For comparison, blood samples were drawn from 16 healthy controls. Plasma samples were analysed by targeted proteome analysis of 276 proteins using immunoaffinity proteomics. Results . Whereas oncostatin M and pentraxin 3 levels appeared generally higher in HTAD patients, after adjusting for several confounders, significantly higher levels for these markers as well as TNF receptor superfamily member 9 (TNFRSF9), granulysin (GNLY), CD5, vasorin and glycoprotein 1b-α (GP1BA) were only observed in LDS patients compared to healthy controls. Levels of TNFRSF9, GNLY, GP1BA and CD5 correlated positively with Th17 and platelet counts. Conclusions . This discovery study suggests that LDS could represent a particular inflammatory subgroup of HTAD patients potentially reflecting the involvement of Th17 and platelet related mechanisms in the progression of TAA. Larger studies are needed to evaluate if the identified proteins could be used as biomarkers in these patients.

[신경과학·뇌질환] Therapeutic frontiers in ALS: iPSC-based drug discovery, cell therapy, and gene therapy-Advances through 2026. 🔁멀티도메인구제

2026-06-15 · Regenerative therapy · 10.1016/j.reth.2026.101150 · rel=0.482 🔗 우리 도메인: neurodegeneration

핵심발견: 2020~2026년 사이 ALS 치료 파이프라인이 iPSC 기반 약물 발견, 세포 이식, 유전자 치료를 통해 확장되었으며, tofersen의 FDA 승인, iPSC 유래 후보약물의 임상 1상 완료, RNAi 및 AAV 기반 유전자 침묵 치료제의 첫 인간 임상 진입, 그리고 TDP-43 기능 장애의 하류 표적인 STMN2를 타겟으로 한 sporadic ALS 치료제 개발이 진전되었다. 방법·데이터: 초록 미기재 검증필요: TDP-43 기능 장애의 하류 표적으로 STMN2를 식별한 근거와 이를 sporadic ALS(전체 사례의 약 90%) 치료 전략으로 일반화한 논리적 타당성 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): STMN2가 TDP-43 기능 장애의 하류 표적으로 식별되었으나, sporadic ALS의 병인 기전이 유전적 ALS와 완전히 동일하지 않을 수 있음에도 불구하고 이를 sporadic ALS 치료의 주요 전략으로 제시하는 것은 생물학적 타당성 측면에서 과장일 수 있음

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Three converging therapeutic paradigms-iPSC-based drug discovery, cell transplantation, and gene therapy-have substantially expanded the therapeutic pipeline for amyotrophic lateral sclerosis (ALS) between 2020 and 2026. The FDA's accelerated approval of tofersen (Qalsody) in April 2023 marked the first treatment targeting a genetic cause of ALS. iPSC-derived drug candidates, including ropinirole and bosutinib, have completed early-phase clinical trials led by Japanese institutions. Cell therapies targeting neuroinflammation through regulatory T cells are being actively explored as immunomodulatory strategies, although efficacy remains to be established in adequately powered trials. Next-generation gene-silencing approaches-including RNA interference (RNAi) therapeutics and AAV-delivered microRNA-entered first-in-human trials in 2024-2025. The identification of STMN2 as a downstream target of TDP-43 dysfunction has opened a potential TDP-43-downstream nucleic acid therapeutic avenue for sporadic ALS, which constitutes approximately 90% of all cases, with company-reported interim data suggesting target engagement in the ongoing Phase 1/2 ANQUR trial (QRL-201). This review synthesizes the latest evidence across all three therapeutic domains, with attention to the hierarchy of evidence, regulatory milestones, and the pioneering contributions of Japanese research groups.

[중독] Antibiotic-mediated gut microbiota depletion partially attenuates methamphetamine-induced reward and linoleic acid metabolic disturbance. 🔁멀티도메인구제

2026-05-13 · Neuropharmacology · 10.1016/j.neuropharm.2026.111022 · rel=0.463 🔗 우리 도메인: addiction-omics

핵심발견: 메암페타민(METH) 노출은 장내 미생물군 변화와 리놀레산(LA) 대사 교란을 유발하며, 항생제(ABX)를 통한 미생물군 고갈은 METH 유도 보상 효과(LA 대사 활성화 포함)를 부분적으로 완화한다. 방법·데이터: 마우스 조건부 장소 선호(CPP) 모델, 장내 미생물군 및 대사체 다중오믹스 프로파일링, 항생제 매개 미생물군 고갈, LA 보충 및 산화 대사 억제 개입. 검증필요: 장내 미생물군, LA 대사체, CPP 점수 간의 상관관계 분석에서 특정 세균 종과 LA 대사체가 METH 보상 기전의 핵심 인자임을 입증하는 인과적 증거의 강도 및 방향성. 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 초록에 'METH 노출은 LA 대사를 증가시켰으나, 장내 미생물군 고갈은 LA 대사 활성화로 이어졌다'고 서술되어 있어, METH가 LA 대사를 증가시켰다면 고갈이 이를 '구제(rescued)'한다는 표현은 METH 유도 증가를 정상화(normalize) 또는 억제(inhibit)했다는 의미로 해석되어야 하는데, 문맥상 METH가 LA 대사를 '증가'시켰고 고갈이 이를 '구제'했다는 서술은 METH가 LA 대사를 억제했을 때 고갈이 이를 활성화시켰다는 논리와 모순되거나, METH가 LA 대사를 증가시켰다면 고갈이 그 증가를 억제했다는 표현이 더 적절함. 즉, METH 노출이 LA 대사를 '증가'시켰다는 전제 하에 고갈이 이를 '구제(rescued)'했다는 표현은 생물학적 방향성(증가 vs 억제)에 대한 명확한 정의 부재로 인한 논리적 비약 의심

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

Methamphetamine (METH) is a highly addictive psychostimulant that possesses potent toxicity to multiple organs. Emerging evidence has suggested associations between gut microbiota dysbiosis and METH-induced rewarding effects. However, the role and underlying mechanisms of gut microbiota in METH addiction remain poorly understood. Using a mouse conditioned place preference (CPP) model combined with multi-omics profiling of gut microbiota and metabolites, we first investigated how METH exposure affects gut microbiota composition. Then, antibiotic (ABX)-mediated gut microbiota depletion was conducted to explore the role of gut microbiota in the METH-induced associative memory of context-reward (METH reward) and metabolic dynamics. Furthermore, associations among gut microbiota, metabolites, and behavioral phenotypes were determined to reveal the potential key microbial taxa and metabolites in METH reward. Finally, the key metabolite was intervened to reveal the role of it in the METH reward. Our results demonstrated that repeated METH administration induced significant alterations in gut microbiota profiles. ABX-mediated microbiota depletion attenuated METH-induced rewarding effects and metabolic perturbations, especially in linoleic acid (LA) metabolism. METH exposure led to an increase in, while gut microbiota depletion rescued the activation of LA metabolism. Correlation analyses consistently demonstrated associations among specific bacterial species, LA metabolites, and CPP scores. Supplementation of LA could facilitate, while inhibition of its oxidative metabolism could attenuate the METH-induced CPP. These findings highlight LA metabolism as a potential mechanistic link between gut microbiota dysbiosis and METH reward. Future gut microbiota-targeted therapeutic interventions, particularly those modulating LA metabolism, may improve the treatment of METH use disorder.

[프로테오믹스] Identification and profiling of HLA-A*02:01-restricted Toxoplasma gondii peptides through immunopeptidomics in HLA-A2.1 transgenic mice. 🔁멀티도메인구제

2026-07-05 · Virulence · 10.1080/21505594.2026.2697091 · rel=0.449 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: HLA-A02:01 전장 생쥐에서 T. gondii 감염 중 제시되는 3,433개의 고신뢰도 펩타이드 리간드ome을 규명하고, 글리코겐 합성효소(PGS) 유래 신규 리간드의 결정구조를 해명함. 방법·데이터: 면역펩티드놈스(질량분석법), HLA-A02:01 전장 생쥐, 초록 미기재 검증필요: in silico 예측과 실험적 검증을 통해 우선순위화된 73개 고친화도 후보 펩타이드의 실제 CD8+ T세포 면역원성 기능 검증 ⚠️[번역오염: 미번역 접합 ['드ome']]

📖 초록(한글 번역, 원문 전문)

병원체 유래 펩타이드의 HLA class I 제시 과정은 Toxoplasma gondii에 대한 CD8+ T세포 인식에 필수적이다. 체외(in vitro) MHC 리간드들이 문서화되어 있으나, 감염 진행 중의 체내(in vivo) 리간드롬(ligandome)은 아직 잘 규명되지 않았다. 본 연구에서는 형질전환 마우스에서 HLA-A *02:01에 의해 제시되는 T. gondii 면역펩티드롬(immunopeptidome)을 직접 프로파일링하기 위해 질량분석법(MS) 기반 면역펩티드믹스(immunoproteomics) 접근법을 사용했다. 계층적 발견 파이프라인(hierarchical discovery funnel)을 적용하여, 우리는 3,744개의 고유한 T. gondii 유래 펩타이드의 포괄적인 레퍼토리를 확인했다. HLA-A *02:01 리간드의 전형적인 결합 길이인 정형 8-12머(8-12mers)에 대한 필터링을 통해, 3,433개의 펩타이드로 구성된 높은 신뢰도의 기초 리간드롬을 확립했다. 원천 단백질 분석 결과, 이러한 펩타이드는 이전에 특징이 잘 규명되지 않은 가설 단백질(hypothetical proteins)을 포함한 다양한 기생충 단백질에서 유래하는 것으로 나타났다. 주목할 만한 점은, 특정 리간드들이 급성기 및 만성기 모두에서 일관되게 검출되어 감염 주기 전반에 걸쳐 안정적인 MHC-I 제시가 이루어짐을 시사한다는 것이다. 생정보학적 예측(in silico predictions)과 실험적 검증을 통합하여, 우리는 73개의 높은 친화도 후보들을 우선순위화했으며, 이 중 5개는 체외(in vitro) 및 체내(in vivo)에서 강력한 HLA-A *02:01 결합 능력을 보였다. 구체적으로, 우리는 글리코겐 합성효소(glycogen synthase, PGS) 유래의 새로운 리간드를 확인하고 HLA-A *02:01과의 공동 결정 구조(co-crystal structure)를 결정하였으며, 이는 유리한 결합 구조(binding architecture)를 드러냈다. 전반적으로, 이러한 발견들은 T. gondii의 HLA-A *02:01 제한적 리간드 지평을 확장하고, 향후 CD8+ T세포 면역원성(functional validation of CD8+ T-cell immunogenicity)을 위한 높은 우선순위 후보 목록을 제공한다.

[생물정보학] INTERPOL Review of Forensic Biology and DNA, 2023-2025. 🔁멀티도메인구제

2026-06-14 · Forensic science international. Synergy · 10.1016/j.fsisyn.2026.100705 · rel=0.449 🔗 우리 도메인: proteomics/MS

핵심발견: 2023-2025년 법의학 생물학 및 DNA 분석 분야의 최신 과학적 발전, 방법론 및 동향을 검토하기 위해 Scopus, Web of Science, PubMed 등 온라인 검색을 통해 2000개 이상의 참고문헌을 선별하고 15개 주제, 116개 하위 주제로 분류하여 정리함. 방법·데이터: 오믹스 종류·코호트·공개데이터셋명. 초록 미기재 검증필요: 초록에 기술된 1900개 이상의 출판물 선별 및 분류 과정에서의 객관성 및 재현성 확보 여부 🔸LLM 확인 필요(미검증·참고용): 인공지능(AI) 도구를 참고문헌 요약에 활용했다고 명시했으나, AI 사용의 구체적 방법론, 검증 절차 또는 편향성 통제 방안이 초록에 미기재되어 있어 방법론적 투명성에 의문

🔎 자동점검(규칙기반·1차 신호): 📄리뷰/perspective(1차연구 아님 — 근거강도 주의)

📖 초록(원문 EN — 한글 번역 실패)

As a part of the 21st INTERPOL International Forensic Science Managers Symposium, this work explores the latest scientific developments, methodologies, and trends in forensic biology and forensic DNA analysis of biological evidence during the years 2023 to 2025 and builds upon previous INTERPOL DNA reviews. Almost 2000 references covering the three-year time range of this review were located via various online searches including use of Scopus, Web of Science, and PubMed. The scientific articles, which originated from more than 300 different journals, were curated in a Zotero reference manager database (see Supplemental File 1) and sorted into 15 topics and 116 sub-topics (see Supplemental File 2) under sections focused on advances in current practices (Section 3) and emerging technologies and research studies (Section 4). This triennial review describes 24 books or major reports, 20 special issues of journals on aspects of forensic DNA, 292 articles from 2 International Society for Forensic Genetics (ISFG) conference proceedings, and 70 guidance documents from 17 different organizations to assist in quality DNA testing. Publications were evaluated and sorted into 10 topics around advances in current practices and 5 topics related to emerging technologies and research studies. These topics, which are further sub-divided in a compiled list (see Supplemental File 2) included rapid DNA analysis; law enforcement DNA databases and ethics; forensic investigative genetic genealogy (FIGG); forensic biology and body fluid identification; DNA processing; DNA typing with short tandem repeat (STR) markers; DNA interpretation at the source or sub-source level of the hierarchy of propositions along with mixture interpretation using probabilistic genotyping software (PGS); DNA interpretation at the activity level along with aspects of DNA transfer, persistence, prevalence, and recovery (TPPR); statistics and population genetic data; human identification and kinship analysis; next-generation sequencing (NGS) and technology developments; forensic DNA phenotyping (FDP) and methylation; lineage markers (Y-chromosome, mitochondrial DNA, X-chromosome analyses); new markers and approaches (microhaplotypes, insertion/deletion markers, proteomics, microbiome, single-cell analysis, using environmental DNA, and biomarkers for diagnosis of sudden death, molecular autopsy, or post-mortem interval); and non-human DNA testing and wildlife forensics. Artificial intelligence (AI) tools for summarizing references were explored and utilized in performing this review of over 1900 publications.

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🔭 주변 관심 (20편 · 관련성 통과했으나 우리 도메인 접점 없음 — 제목·rel만)

• [HCP] Host cell protein profiling and immunogenicity assessment in E. coli-produced interferon beta. · rel=0.685 · 2026-07-14 · Journal of pharmaceutical sciences · 10.1016/j.xphs.2026.104418
• [멀티오믹스] Multi-omic modelling of body mass index response to a dietary weight loss intervention. · rel=0.6 · 2026-07-15 · Gut microbes · 10.1080/19490976.2026.2696645
• [멀티오믹스] Multiomics integrative bioinformatics analysis of gene expression characteristics and molecular mechanisms in preeclampsia placental tissue. · rel=0.59 · 2026-07-20 · Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology · 10.1080/21691401.2026.2697688
• [RNA-seq] Integrative single-cell and spatial transcriptomic approaches to decipher the tumor microenvironment and therapeutic resistance in pancreatic cancer. · rel=0.571 · 2026-07-07 · Cancer biology & therapy · 10.1080/15384047.2026.2699508
• [RNA-seq] Investigating and validating the molecular mechanisms of lipid metabolism regulation in myasthenia gravis development based on single-cell, bulk transcriptomics, and RT-qPCR. · rel=0.562 · 2026-07-18 · Autoimmunity · 10.1080/08916934.2026.2696588
• [ELISA] Next-generation immunoassays for autoantibody detection in celiac disease: emerging technologies and diagnostic advances. · rel=0.562 · 2026-07-17 · Annals of medicine · 10.1080/07853890.2026.2703356
• [멀티오믹스] Exploratory multi-omics links CCL2/TIMP1 axis to immunosuppressive TME in glioblastoma. · rel=0.555 · 2026-07-15 · Cell cycle (Georgetown, Tex.) · 10.1080/15384101.2026.2703934
• [GWAS] Genetic liability for morning chronotype interacts with childhood trauma to predict depressive symptoms in women. · rel=0.53 · 2026-07-19 · Dialogues in clinical neuroscience · 10.1080/19585969.2026.2702037
• [GWAS] Mitochondria-related pathogenic genes in acute and chronic kidney disease: a Mendelian randomization study. · rel=0.524 · 2026-07-08 · Renal failure · 10.1080/0886022x.2026.2698274
• [GWAS] Causal association and shared mechanisms between Graves' disease and prostate cancer: insights from Mendelian randomization, machine learning, and comprehensive bioinformatics. · rel=0.523 · 2026-07-15 · The aging male : the official journal of the International Society for the Study of the Aging Male · 10.1080/13685538.2026.2695558
• [약물재배치] Repurposing the antispasmodic drug pinaverium bromide as a novel antifungal agent and synergist against Candida albicans . · rel=0.519 · 2026-06-01 · Virulence · 10.1080/21505594.2026.2682573
• [PTM] The acetylation mechanism and engineering strategy of isocitrate lyase for optimizing biosynthesis in Escherichia coli . · rel=0.518 · 2026-05-23 · Synthetic and systems biotechnology · 10.1016/j.synbio.2026.04.031
• [RNA-seq] Single-cell sequencing profiling of intratumoral heterogeneity and immunosuppressive microenvironment in primary thyroid cancer and lymph node metastases. · rel=0.513 · 2026-07-10 · Oncoimmunology · 10.1080/2162402x.2026.2701504
• [ELISA] A rapid yolk-sac serum extraction method for quantifying maternal IgY of individual birds. · rel=0.513 · 2026-07-03 · MethodsX · 10.1016/j.mex.2026.104027
• [약물재배치] The role of protein palmitoylation in disease pathogenesis and therapeutic innovation. · rel=0.507 · 2026-05-29 · Annals of medicine · 10.1080/07853890.2026.2673182
• [PTM] Eukaryotic cell-free protein synthesis: Chassis diversification, system engineering, and emerging applications. · rel=0.507 · 2026-05-21 · Synthetic and systems biotechnology · 10.1016/j.synbio.2026.04.022
• [희귀질환] Serum metabolic profiling analysis of Gitelman syndrome using untargeted metabolomics. · rel=0.475 · 2026-04-29 · Renal failure · 10.1080/0886022x.2026.2662094
• [약물재배치] Repurposing nitazoxanide as a novel ferroptosis inducer for triple-negative breast cancer via dual disruption of iron homeostasis and the β-catenin/GPX4 axis. · rel=0.473 · 2026-06-29 · Redox report : communications in free radical research · 10.1080/13510002.2026.2695689
• [희귀질환] Transcriptional profiling of Hutchinson-Gilford progeria patients identifies primary target pathways of progerin. · rel=0.44 · 2026-01-05 · Nucleus (Austin, Tex.) · 10.1080/19491034.2025.2611484
• [기타/미분류] Nanozymes: bridging nanoscale characteristics and catalytic mechanisms for advanced biomedical applications. · rel=0.512 · 2026-06-22 · Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry · 10.1080/14756366.2026.2690829

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🆕 신규 공개 데이터셋 (PRIDE/GEO · 재분석 후보)

• [uncertain] GEO:GSE339586 · 2026-07-22 · 검색:cultured-meat · rel=0.449 — Extensive Crosstalk between BMP and Notch Signaling Pathways in Activated Adult Muscle Stem Cells [RNA-seq III]
  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/?term=GSE339586

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🩺 실행 진단

• 관련성 게이트: BGE 관련성 게이트 · 후보 128 = 오프토픽 47 + 쿼터/캡컷 36 + 채택 45
• ★캡컷 상위(관련성 통과했으나 쿼터/캡 탈락): Cell culture medium formulation can be a driver of lipoprotein lipase (rel=0.598·HCP); Development of single-chain C1q affinity chromatography-mass spectrome(rel=0.586·항체-topdown); Purification of Advanced Therapeutics by Flow-Through Pseudo-Affinity (rel=0.576·HCP); Key molecular networks underlying retinol's biphasic effects on cell p(rel=0.553·멀티오믹스); The double-edged nature of antibody bivalency: mathematical and experi(rel=0.512·ADC)
• 브릿지: 신규 데이터셋 1/1건 유효(관련성·서브시리즈 필터 후) · 엔진 gap 0편(도메인/임계 필터로 전량 탈락 — 정직 보고)
• 라벨 강등(신뢰도<0.5): 1편 [기타/미분류]
• 요약노드 7/8 사용 · 죽은 노드: 172.20.0.19:11209
• 요약 실패(무음 전멸): 0편
• ★무음 부분실패(핵심발견 등 핵심필드 공란): 1편 ([희귀질환] Serum metabolic profiling analysis of Gi (검증필요 플레이스홀더)) — 카드는 유지되나 필드 미완, 사람 확인 권장
• ★개체명 불일치(핵심발견 질병명이 타필드와 충돌 — 요약 환각 의심, F-01): 0편
• ★요약↔원문 정합성 위반(심볼 환각·수준 혼동, B게이트): 0편